AT3G48540.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:mitochondrion 1.000 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : Cytidine/deoxycytidylate deaminase family protein | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
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| Computational Description (TAIR10) |
Cytidine/deoxycytidylate deaminase family protein; FUNCTIONS IN: hydrolase activity, zinc ion binding, catalytic activity; INVOLVED IN: biological_process unknown; LOCATED IN: endomembrane system; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: APOBEC/CMP deaminase, zinc-binding (InterPro:IPR016192), CMP/dCMP deaminase, zinc-binding (InterPro:IPR002125), Cytidine deaminase-like (InterPro:IPR016193), Cytidine deaminase (InterPro:IPR015517); Has 3737 Blast hits to 3733 proteins in 1421 species: Archae - 65; Bacteria - 2323; Metazoa - 218; Fungi - 134; Plants - 52; Viruses - 89; Other Eukaryotes - 856 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr3:-:17989798..17992015 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 25860.00 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 8.92 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.23 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 232 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MNSRDLTLVS TSAIFGALIS ALAFRFFSSN PKNPKSRKFT STEISAISRK FPALDPFSPL KRNGYLSWDD YFMAIAFLSA ERSKDPNRQV GACLVSQNGV 101: ILGIGYNGFP RGCSDDKLPW AKKSRTGDPL ETKYPYVCHA EVNAILNTNH ASAAGQKLYV TMFPCNECAK IILQSGVAEV IYFVEKRPND SDVAYVASHK 201: LLSMANVKVR KHQPEMDEIL IKFEEHLLQP ET |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)