AT3G46940.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:nucleus 1.000 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : DUTP-PYROPHOSPHATASE-LIKE 1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
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| Computational Description (TAIR10) |
DUTP-PYROPHOSPHATASE-LIKE 1 (DUT1); FUNCTIONS IN: hydrolase activity, dUTP diphosphatase activity; INVOLVED IN: DNA repair, 2'-deoxyribonucleotide metabolic process; LOCATED IN: cellular_component unknown; EXPRESSED IN: 22 plant structures; EXPRESSED DURING: 13 growth stages; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: DeoxyUTP pyrophosphatase domain, subfamily 1, (InterPro:IPR008181), DeoxyUTP pyrophosphatase domain (InterPro:IPR008180); Has 7764 Blast hits to 7750 proteins in 2463 species: Archae - 14; Bacteria - 4311; Metazoa - 248; Fungi - 161; Plants - 56; Viruses - 831; Other Eukaryotes - 2143 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr3:-:17288367..17288867 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 17557.80 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 5.25 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.12 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 166 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MACVNEPSPK LQKLDRNGIH GDSSPSPFFK VKKLSEKAVI PTRGSPLSAG YDLSSAVDSK VPARGKALIP TDLSIAVPEG TYARIAPRSG LAWKHSIDVG 101: AGVIDADYRG PVGVILFNHS DADFEVKFGD RIAQLIIEKI VTPDVVEVDD LDETVRGDGG FGSTGV |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)