AT3G29035.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:nucleus 1.000 ASURE: nucleus What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : NAC domain containing protein 3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
Encodes a protein with transcription factor activity. Note: this protein (AT3G29035) on occasion has also been referred to as AtNAC3, not to be confused with the AtNAC3 found at locus AT3G15500. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
NAC domain containing protein 3 (NAC3); CONTAINS InterPro DOMAIN/s: No apical meristem (NAM) protein (InterPro:IPR003441); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: NAC domain containing protein 6 (TAIR:AT5G39610.1); Has 2988 Blast hits to 2981 proteins in 79 species: Archae - 0; Bacteria - 0; Metazoa - 0; Fungi - 0; Plants - 2988; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 0 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr3:+:11033839..11035006 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 35827.40 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 8.42 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.52 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 318 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MDYKVSRSGE IVEGEVEDSE KIDLPPGFRF HPTDEELITH YLRPKVVNSF FSAIAIGEVD LNKVEPWDLP WKAKLGEKEW YFFCVRDRKY PTGLRTNRAT 101: KAGYWKATGK DKEIFKGKSL VGMKKTLVFY KGRAPKGVKT NWVMHEYRLE GKFAIDNLSK TAKNECVISR VFHTRTDGTK EHMSVGLPPL MDSSPYLKSR 201: GQDSLAGTTL GGLLSHVTYF SDQTTDDKSL VADFKTTMFG SGSTNFLPNI GSLLDFDPLF LQNNSSVLKM LLDNEETQFK KNLHNSGSSE SELTASSWQG 301: HNSYGSTGPV NLDCVWKF |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)