AT3G23870.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:plasma membrane 0.638 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : Protein of unknown function (DUF803) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
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| Computational Description (TAIR10) |
Protein of unknown function (DUF803); CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Protein of unknown function DUF803 (InterPro:IPR008521); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: Protein of unknown function (DUF803) (TAIR:AT4G13800.1); Has 1388 Blast hits to 1369 proteins in 245 species: Archae - 2; Bacteria - 146; Metazoa - 422; Fungi - 370; Plants - 270; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 178 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr3:+:8620253..8621755 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 36294.00 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 9.41 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | 0.64 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 335 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MDQMSPDNIN GVILAVSSSI FIGSSFIIKK KGLKKAGASG VRAGEGGYGY LKEPWWWAGM ITMIVGEVAN FAAYAFAPAI LVTPLGALSI IFSAVLAHFI 101: LKEKLHMFGI LGCILCVVGS TTIVLHAPHE QKIESVKQIW QLAIEPGFLV YSAVIVIVVA ILIFYYEPRY GKTHMIVYVG ICSLMGSLTV MSVKAVAIAI 201: KLTFSGTNQF KYFNTWIFIL VVATCCILQI NYLNKALDTF NTAVISPVYY VMFTTFTIIA SMIMFKDWAS QSGLKIATEL CGFVTILSGT FLLHKTKDMG 301: NSASGRGSIS MPTRDTPVFT NSGSGRSSSS DKVAS |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)