AT3G20040.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:mitochondrion 1.000 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : Hexokinase | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
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| Computational Description (TAIR10) |
ATHXK4; FUNCTIONS IN: hexokinase activity, ATP binding; INVOLVED IN: glucose catabolic process to butanediol, glucose catabolic process to lactate and acetate, glycolysis, carbohydrate metabolic process, glucose catabolic process to D-lactate and ethanol; LOCATED IN: mitochondrion; EXPRESSED IN: 17 plant structures; EXPRESSED DURING: 8 growth stages; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Hexokinase, N-terminal (InterPro:IPR022672), Hexokinase, C-terminal (InterPro:IPR022673), Hexokinase (InterPro:IPR001312); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: hexokinase-like 1 (TAIR:AT1G50460.1); Has 2384 Blast hits to 2114 proteins in 325 species: Archae - 0; Bacteria - 92; Metazoa - 1269; Fungi - 602; Plants - 288; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 133 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr3:+:6995317..6998064 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 54958.80 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 8.12 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | 0.01 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 502 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MGKVLVMLTA AAAVVACSVA TVMVRRRMKG RRKWRRVVGL LKDLEEACET PLGRLRQMVD AIAVEMQAGL VSEGGSKLKM LLTFVDDLPN GSETGTYYAL 101: HLGGSYFRII KVHLGGQRSS LEVQDVERHS IPTSLMNSTS EVLFDFLASS LQRFIEKEGN DFSLSQPLKR ELAFTFSFPV KQTSISSGVL IKWTKGFAIS 201: EMAGEDIAEC LQGALNKRGL DIRVAALVND TVGALSFGHF HDPDTIAAVV FGTGSNACYL ERTDAIIKCQ NPRTTSGSMV VNMEWGNFWS SRLPRTSYDL 301: ELDAESMNSN DMGFEKMIGG MYLGDIVRRV ILRMSQESDI FGPISSILST PFVLRTNSVS AMHEDDTSEL QEVARILKDL GVSEVPMKVR KLVVKICDVV 401: TRRAARLAAA GIAGILKKVG RDGSGGGRRS DKQIMRRTVV AVEGGLYLNY RMFREYMDEA LRDILGEDVA QHVVVKAMED GSSIGSALLL ASSQSVQTIP 501: SV |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)