AT3G16440.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:plasma membrane 0.800 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : myrosinase-binding protein-like protein-300B | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
myrosinase-binding protein-like protein (AtMLP-300B) mRNA, | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
myrosinase-binding protein-like protein-300B (MLP-300B); CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Mannose-binding lectin (InterPro:IPR001229); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: Mannose-binding lectin superfamily protein (TAIR:AT3G16450.3); Has 1615 Blast hits to 760 proteins in 47 species: Archae - 0; Bacteria - 26; Metazoa - 0; Fungi - 2; Plants - 1582; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 5 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr3:+:5586087..5587541 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 32346.00 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 4.55 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.20 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 300 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MAQKVEAQGG IGGDVWDDGA HDGVRKVHVG QGLDGVSFIN VVYENGSQEV VGGEHGKKSL IGIETFEVDA DDYIVAVQVT YDKIFGYDSD IITSITFSTF 101: KGKTSPPYGL DTENKFVLKE KNGGKLVGFH GRAGEILYAL GAYFTTTTTP LTPAKKLPAV GGDEGTAWDD GAFDGVKKVY IGQAQDGISA VKFVYDKGAE 201: DIVGDEHGND TLLGFEEFQL DYPSEYITAV EGTYDKIFGF ETEVINMLRF KTNKKTSPPF GIEAGTAFEL KEEGCKIVGF HGKVSAVLHQ FGVHILPVTN |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)