AT1G51470.1
|
Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:extracellular 1.000 What is SUBAcon? |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Experimental Localisations and PPI |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|
SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Description (TAIR10) | protein_coding : beta glucosidase 35 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
Encodes a myrosinase. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
beta glucosidase 35 (BGLU35); FUNCTIONS IN: thioglucosidase activity, beta-glucosidase activity, hydrolase activity, hydrolyzing O-glycosyl compounds; INVOLVED IN: response to salt stress; LOCATED IN: endomembrane system; EXPRESSED IN: root; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Glycoside hydrolase, family 1 (InterPro:IPR001360), Glycoside hydrolase, family 1, active site (InterPro:IPR018120), Glycoside hydrolase, catalytic core (InterPro:IPR017853), Glycoside hydrolase, subgroup, catalytic core (InterPro:IPR013781); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: beta glucosidase 34 (TAIR:AT1G47600.1); Has 11150 Blast hits to 10820 proteins in 1459 species: Archae - 142; Bacteria - 7670; Metazoa - 713; Fungi - 195; Plants - 1442; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 988 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Coordinates (TAIR10) | chr1:+:19087424..19090248 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 57471.20 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 8.21 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.29 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 511 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MAIPKAHYSL AVLVLLFVVV SSSQKVCNPE CKAKEPFHCD NTHAFNRSGF PKNFTFGAAT SAYQIEGAAH RALNGWDYFT HRYPEKVPDR SSADLACDSY 101: DLYKDDVKLL KRMNVQAYRL SIAWSRVLPK GRLTGGVDEN GITYYNNLIN ELKANGIEPY VTIFHWDVPQ TLEDEYGGFL STRIVEDYTN YAELLFQRFG 201: DRVKFWITLN QPLSLALKGY GNGSYPPGRC TGCELGGDSG VEPYTVAHNQ LLAHAKTVSL YRKRYQKFQG GKIGTTLIGR WFVPLNEFSE LDKAAAKRAF 301: DFFVGWFLDP LVYGKYPTIM REMVGDRLPE FTPEESALVK GSLDFLGLNY YVSQYATDAP PPTQPNAITD ARVTLGFYRN GSPIGVVASS FVYYPPGFRQ 401: ILNYIKDNYK NPLTYITENG VADLDLGNVT LATALADNGR IQNHCSHLSC LKCAMKDGCN VAGYFAWSLM DNYEFGNGYT LRFGMNWVNF TNPADRKEKA 501: SGKWFSKFLA K |
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| See Also |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)