AT3G14150.1
|
Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:peroxisome 1.000 ASURE: peroxisome What is SUBAcon? |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Experimental Localisations and PPI |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|
SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Description (TAIR10) | protein_coding : Aldolase-type TIM barrel family protein | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
Aldolase-type TIM barrel family protein; FUNCTIONS IN: glycolate oxidase activity, oxidoreductase activity, FMN binding, catalytic activity; INVOLVED IN: oxidation reduction, metabolic process; LOCATED IN: peroxisome; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Aldolase-type TIM barrel (InterPro:IPR013785), FMN-dependent alpha-hydroxy acid dehydrogenase, active site (InterPro:IPR008259), FMN-dependent dehydrogenase (InterPro:IPR000262), Alpha-hydroxy acid dehydrogenase, FMN-dependent (InterPro:IPR012133); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: Aldolase-type TIM barrel family protein (TAIR:AT3G14130.1); Has 14086 Blast hits to 14066 proteins in 2250 species: Archae - 261; Bacteria - 6825; Metazoa - 476; Fungi - 830; Plants - 349; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 5345 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Coordinates (TAIR10) | chr3:-:4690667..4692679 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 40132.80 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 8.58 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.05 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 363 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MDQIVNVDEF QELAKQALPK MYYDFYNGGA EDQHTLNENV QAFRRIMFRP RVLVDVSKID MSTKILGYPI SAPIMIAPTG NHKLAHPEGE TATAKAAAAC 101: NTIMIVSYMS SCTFEEIASS CNAVRFLQIY VYKRRDITAQ VVKRAEKAGF KAIVLTVDVP RLGRREADIK NKMISPQLKN FEGLFSTEVR PSKGSGVQAF 201: ASRAFDASFS WKDIEWLRSI TELPILVKGI LTREDALKAV EAGVDGIIVS NHGGRQLDYS PATITVLEEV VQVVRGRIPV LLDGGVRRGT DVFKALALGA 301: QAVLIGRPII YGLAAKGEDG VKKVIDMLKN EFEITMALSG CPTIDDITRN HVRTENERLH SML |
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| See Also |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)