AT3G10410.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:vacuole 1.000 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : SERINE CARBOXYPEPTIDASE-LIKE 49 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
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| Computational Description (TAIR10) |
SERINE CARBOXYPEPTIDASE-LIKE 49 (SCPL49); FUNCTIONS IN: serine-type carboxypeptidase activity; INVOLVED IN: proteolysis; LOCATED IN: vacuole; EXPRESSED IN: 25 plant structures; EXPRESSED DURING: 15 growth stages; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Peptidase S10, serine carboxypeptidase (InterPro:IPR001563), Peptidase S10, serine carboxypeptidase, active site (InterPro:IPR018202); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: serine carboxypeptidase-like 48 (TAIR:AT3G45010.1); Has 3569 Blast hits to 3439 proteins in 342 species: Archae - 0; Bacteria - 147; Metazoa - 678; Fungi - 883; Plants - 1454; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 407 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr3:-:3235518..3238063 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 57304.50 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 5.03 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.08 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 516 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MEKLTFLSLL LHFVVFIAST IPSSSFLLND RTFERSNLPS TRAEKLIREL NLFPQQDLNV IDVADLPLTA AEGPGIVERK FVFPNILADG GPTVDDLGHH 101: AGYYKLPKSR GASMFYFFFE SRNKKDAPVV IWLTGGPGCS SELAVFYENG PFKITSNMSL AWNEYGWDQV SNLLYVDQPV GTGFSYTTDK SDIRHDETGV 201: SNDLYDFLQA FFAEHPKLAK NDFYITGESY AGHYIPAFAS RVHKGNKANE GVHINLKGFA IGNGLTDPAL QYPAYPDYAL EMGLITQKEH DRLEKIVPLC 301: ELSIKLCGTD GTTSCLASYL VCNSLFSGVM SHAGGVNYYD IRKKCVGSLC YDFSNMEKFL NLQSVRKSLG VGDIDFVSCS TSVYQAMLVD WMRNLEVGIP 401: TLLEDGISLL VYAGEYDLIC NWLGNSRWVN AMEWSGKTNF GAAKEVPFIV DGKEAGLLKT YEQLSFLKVR DAGHMVPMDQ PKAALKMLKR WMENSLIEDA 501: TVTVAAQGGE ELVAQM |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)