AT5G57110.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:plasma membrane 1.000 ASURE: plasma membrane What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : autoinhibited Ca2+ -ATPase, isoform 8 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
Arabidopsis-autoinhibited Ca2+ -ATPase, isoform 8, contains all of the characteristic motifs of Ca2+ -transporting P-type Ca2+ -ATPases and is localized to the plasma membrane. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
autoinhibited Ca2+ -ATPase, isoform 8 (ACA8); FUNCTIONS IN: protein self-association, calcium-transporting ATPase activity, calmodulin binding; INVOLVED IN: response to nematode; LOCATED IN: plasma membrane, membrane; EXPRESSED IN: 26 plant structures; EXPRESSED DURING: 13 growth stages; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: ATPase, P-type, ATPase-associated domain (InterPro:IPR008250), ATPase, P-type, calcium-transporting, PMCA-type (InterPro:IPR006408), ATPase, P-type, H+ transporting proton pump (InterPro:IPR000695), ATPase, P-type cation-transporter, N-terminal (InterPro:IPR004014), Haloacid dehalogenase-like hydrolase (InterPro:IPR005834), ATPase, P-type, K/Mg/Cd/Cu/Zn/Na/Ca/Na/H-transporter (InterPro:IPR001757), ATPase, P-type phosphorylation site (InterPro:IPR018303), ATPase, P-type cation-transporter, C-terminal (InterPro:IPR006068); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: autoinhibited Ca(2+)-ATPase 10 (TAIR:AT4G29900.1); Has 45378 Blast hits to 34457 proteins in 3207 species: Archae - 868; Bacteria - 31014; Metazoa - 4020; Fungi - 2704; Plants - 2112; Viruses - 3; Other Eukaryotes - 4657 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr5:-:23109729..23116857 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 116181.00 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 7.92 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | 0.03 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 1074 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
0001: MTSLLKSSPG RRRGGDVESG KSEHADSDSD TFYIPSKNAS IERLQQWRKA ALVLNASRRF RYTLDLKKEQ ETREMRQKIR SHAHALLAAN RFMDMGRESG 0101: VEKTTGPATP AGDFGITPEQ LVIMSKDHNS GALEQYGGTQ GLANLLKTNP EKGISGDDDD LLKRKTIYGS NTYPRKKGKG FLRFLWDACH DLTLIILMVA 0201: AVASLALGIK TEGIKEGWYD GGSIAFAVIL VIVVTAVSDY KQSLQFQNLN DEKRNIHLEV LRGGRRVEIS IYDIVVGDVI PLNIGNQVPA DGVLISGHSL 0301: ALDESSMTGE SKIVNKDANK DPFLMSGCKV ADGNGSMLVT GVGVNTEWGL LMASISEDNG EETPLQVRLN GVATFIGSIG LAVAAAVLVI LLTRYFTGHT 0401: KDNNGGPQFV KGKTKVGHVI DDVVKVLTVA VTIVVVAVPE GLPLAVTLTL AYSMRKMMAD KALVRRLSAC ETMGSATTIC SDKTGTLTLN QMTVVESYAG 0501: GKKTDTEQLP ATITSLVVEG ISQNTTGSIF VPEGGGDLEY SGSPTEKAIL GWGVKLGMNF ETARSQSSIL HAFPFNSEKK RGGVAVKTAD GEVHVHWKGA 0601: SEIVLASCRS YIDEDGNVAP MTDDKASFFK NGINDMAGRT LRCVALAFRT YEAEKVPTGE ELSKWVLPED DLILLAIVGI KDPCRPGVKD SVVLCQNAGV 0701: KVRMVTGDNV QTARAIALEC GILSSDADLS EPTLIEGKSF REMTDAERDK ISDKISVMGR SSPNDKLLLV QSLRRQGHVV AVTGDGTNDA PALHEADIGL 0801: AMGIAGTEVA KESSDIIILD DNFASVVKVV RWGRSVYANI QKFIQFQLTV NVAALVINVV AAISSGDVPL TAVQLLWVNL IMDTLGALAL ATEPPTDHLM 0901: GRPPVGRKEP LITNIMWRNL LIQAIYQVSV LLTLNFRGIS ILGLEHEVHE HATRVKNTII FNAFVLCQAF NEFNARKPDE KNIFKGVIKN RLFMGIIVIT 1001: LVLQVIIVEF LGKFASTTKL NWKQWLICVG IGVISWPLAL VGKFIPVPAA PISNKLKVLK FWGKKKNSSG EGSL |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)