AT2G19450.1
Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min: :max .
SUBAcon:plasma membrane 1.000 What is SUBAcon? |
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Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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Description (TAIR10) | protein_coding : membrane bound O-acyl transferase (MBOAT) family protein | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Curator Summary (TAIR10) |
Encodes Acyl-CoA:diacylglycerol acyltransferase (DGAT) catalyzes the final step of the triacylglycerol synthesis pathway. An insertion mutation in the TAG1 gene results in altered lipid phenotype. Role in senescence and seed development. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Computational Description (TAIR10) |
TRIACYLGLYCEROL BIOSYNTHESIS DEFECT 1 (TAG1); CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Membrane bound O-acyl transferase, MBOAT (InterPro:IPR004299); Has 951 Blast hits to 945 proteins in 279 species: Archae - 0; Bacteria - 104; Metazoa - 315; Fungi - 305; Plants - 83; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 144 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Protein Annotations |
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Coordinates (TAIR10) | chr2:+:8426436..8429455 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecular Weight (calculated) | 58989.10 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
IEP (calculated) | 8.64 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
GRAVY (calculated) | 0.24 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Length | 520 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MAILDSAGVT TVTENGGGEF VDLDRLRRRK SRSDSSNGLL LSGSDNNSPS DDVGAPADVR DRIDSVVNDD AQGTANLAGD NNGGGDNNGG GRGGGEGRGN 101: ADATFTYRPS VPAHRRARES PLSSDAIFKQ SHAGLFNLCV VVLIAVNSRL IIENLMKYGW LIRTDFWFSS RSLRDWPLFM CCISLSIFPL AAFTVEKLVL 201: QKYISEPVVI FLHIIITMTE VLYPVYVTLR CDSAFLSGVT LMLLTCIVWL KLVSYAHTSY DIRSLANAAD KANPEVSYYV SLKSLAYFMV APTLCYQPSY 301: PRSACIRKGW VARQFAKLVI FTGFMGFIIE QYINPIVRNS KHPLKGDLLY AIERVLKLSV PNLYVWLCMF YCFFHLWLNI LAELLCFGDR EFYKDWWNAK 401: SVGDYWRMWN MPVHKWMVRH IYFPCLRSKI PKTLAIIIAF LVSAVFHELC IAVPCRLFKL WAFLGIMFQV PLVFITNYLQ ERFGSTVGNM IFWFIFCIFG 501: QPMCVLLYYH DLMNRKGSMS |
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See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)