AT3G07930.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:nucleus 1.000 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : DNA glycosylase superfamily protein | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
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| Computational Description (TAIR10) |
DNA glycosylase superfamily protein; Has 117 Blast hits to 117 proteins in 38 species: Archae - 0; Bacteria - 0; Metazoa - 67; Fungi - 0; Plants - 44; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 6 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr3:+:2526720..2528145 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 40261.90 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 7.94 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.82 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 352 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MVPPIIYKYK RRKDRRLGRD DDSSVMMTRR RPDSDFIEVS DENRSFALFK EDDEKNRDLG LVDDGSTNLV LQCHDDGCSL EKDNSNSLDD LFSGFVYKGV 101: RRRKRDDFGS ITTSNLVSPQ IADDDDDSVS DSHIERQECS EFHVEVRRVS PYFQGSTVSQ QSKEGCDSDS VCSKEGCSKV QAKVPRVSPY FQASTISQCD 201: SDIVSSSQSG RNYRKGSSKR QVKVRRVSPY FQESTVSEQP NQAPKGLRNY FKVVKVSRYF HADGIQVNES QKEKSRNVRK TPIVSPVLSL SQKTDDVYLR 301: KTPDNTWVPP RSPCNLLQED HWHDPWRVLV ICMLLNKTSD AGSDIRLVWI VY |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)