AT3G01440.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:plastid 1.000 ASURE: plastid What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : PsbQ-like 1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
Encodes a subunit of the NAD(P)H complex located in the chloroplast thylakoid lumen. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
PsbQ-like 1 (PQL1); FUNCTIONS IN: electron transporter, transferring electrons within the cyclic electron transport pathway of photosynthesis activity; INVOLVED IN: photosynthesis, light reaction, photosynthetic electron transport chain; LOCATED IN: in 7 components; EXPRESSED IN: 20 plant structures; EXPRESSED DURING: 13 growth stages; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Photosystem II oxygen evolving complex protein PsbQ (InterPro:IPR008797); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: photosystem II subunit QA (TAIR:AT4G21280.1); Has 165 Blast hits to 165 proteins in 26 species: Archae - 0; Bacteria - 0; Metazoa - 0; Fungi - 0; Plants - 165; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 0 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr3:+:168478..169407 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 24782.80 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 8.16 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.34 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 220 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MAHFIDLNSL TNTLPSLPKL PESRKTGKSS GFACRRTEEF QEPDSVQITR RMTLGFAVSI GLTGILGENN VSLAQDNGFW IDGPLPIPPI YNNIVNEKTG 101: TRTFIKKGVY VADIGTKGRM YRVKKNAFDL LAMEDLIGPD TLNYVKKYLR LKSTFLFYDF DNLISAAASE DKQPLTDLAN RLFDNFEKLE DAAKTKNLAE 201: TESCYKDTKF LLQEVMTRMA |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)