AT1G14150.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:plastid 1.000 ASURE: plastid What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : PsbQ-like 2 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
Encodes a subunit of the NAD(P)H dehydrogenase complex located in the chloroplast thylakoid lumen. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
PsbQ-like 2 (PQL2); FUNCTIONS IN: electron transporter, transferring electrons within the cyclic electron transport pathway of photosynthesis activity; INVOLVED IN: photosynthetic electron transport chain; LOCATED IN: in 6 components; EXPRESSED IN: 22 plant structures; EXPRESSED DURING: 13 growth stages; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Photosystem II oxygen evolving complex protein PsbQ (InterPro:IPR008797); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: photosystem II subunit Q-2 (TAIR:AT4G05180.1); Has 142 Blast hits to 142 proteins in 27 species: Archae - 0; Bacteria - 0; Metazoa - 0; Fungi - 0; Plants - 142; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 0 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr1:+:4839885..4840632 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 22158.60 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 8.93 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.39 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 190 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MSSFTTTNTP PPYLLRKIYH RRVNQPFSVV CCTGEPQQDI FTRRRTLTSL ITFTVIGGAT SSALAQEKWG TRSFIKEKYF MPGLSPEDAA ARIKQTAEGL 101: RDMREMLDHM SWRYVIFYIR LKQAYLSQDL TNAMNILPES RRNDYVQAAN ELVENMSELD FYVRTPKVYE SYLYYEKTLK SIDNVVEFLA |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)