AT2G47760.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:golgi 0.963 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : asparagine-linked glycosylation 3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
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| Computational Description (TAIR10) |
asparagine-linked glycosylation 3 (ALG3); CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Glycosyltransferase, ALG3 (InterPro:IPR007873); Has 381 Blast hits to 338 proteins in 173 species: Archae - 2; Bacteria - 2; Metazoa - 149; Fungi - 152; Plants - 35; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 41 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr2:-:19565672..19568221 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 49245.40 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 9.82 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | 0.68 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 438 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MAGASSPASL RASRSRRLGK ETNRSDLFKK PAVPFAFALI LADAILVALI IAYVPYTKID WDAYMSQVSG FLGGERDYGN LKGDTGPLVY PAGFLYVYSA 101: VQNLTGGEVY PAQILFGVLY IVNLGIVLII YVKTDVVPWW ALSLLCLSKR IHSIFVLRLF NDCFAMTLLH ASMALFLYRK WHLGMLVFSG AVSVKMNVLL 201: YAPTLLLLLL KAMNIIGVVS ALAGAALVQI LVGLPFLITY PVSYIANAFD LGRVFIHFWS VNFKFVPERV FVSKEFAVCL LIAHLFLLVA FANYKWCKHE 301: GGIIGFMRSR HFFLTLPSSL SFSDVSASRI ITKEHVVTAM FVGNFIGIVF ARSLHYQFYS WYFYSLPYLL WRTPFPTWLR LIMFLGIELC WNVYPSTPSS 401: SGLLLCLHLI ILVGLWLAPS VDPYQLKEHP KSQIHKKA |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)