AT2G43760.1
Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min: :max .
SUBAcon:nucleus 0.913 What is SUBAcon? |
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Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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Description (TAIR10) | protein_coding : molybdopterin biosynthesis MoaE family protein | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Curator Summary (TAIR10) |
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Computational Description (TAIR10) |
molybdopterin biosynthesis MoaE family protein; FUNCTIONS IN: molecular_function unknown; INVOLVED IN: Mo-molybdopterin cofactor biosynthetic process; LOCATED IN: cellular_component unknown; EXPRESSED IN: 22 plant structures; EXPRESSED DURING: 13 growth stages; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Molybdopterin biosynthesis MoaE (InterPro:IPR003448); Has 4667 Blast hits to 4667 proteins in 1622 species: Archae - 178; Bacteria - 3163; Metazoa - 146; Fungi - 92; Plants - 52; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 1036 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Protein Annotations |
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Coordinates (TAIR10) | chr2:+:18133276..18133872 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecular Weight (calculated) | 22217.50 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
IEP (calculated) | 5.98 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
GRAVY (calculated) | -0.39 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Length | 198 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MSAEEKNLIE ILEEGHKVDV VKYIDYVSAP QAGAIATFSG TTRDMFEGKT VLELRYEAYV PMATRCLSSI CTTARSTWDI HKIAVAHRLG PVPVGETSVL 101: IAVSSVHRAD GLDACKFLID ELKASVPIWK KEVYTNGEIW KENSEFMEKR LELAEKRDSI VKKTVVEEHR RRGCCGSKVR VEEDEEHKDI TGDNKSSS |
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See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)