AT2G43430.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:mitochondrion 1.000 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : glyoxalase 2-1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
Encodes a predicted mitochondrial glyoxalase GLX2-1. Studies using recombinant protein show that GLX2-1 contains a dinuclear metal binding site, but does not have glyoxalase 2 activity. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
glyoxalase 2-1 (GLX2-1); CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Beta-lactamase, class B, conserved site (InterPro:IPR001018), Beta-lactamase-like (InterPro:IPR001279), Hydroxyacylglutathione hydrolase (InterPro:IPR017782); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: glyoxalase 2-4 (TAIR:AT1G06130.2); Has 15540 Blast hits to 15539 proteins in 2481 species: Archae - 339; Bacteria - 10160; Metazoa - 480; Fungi - 326; Plants - 230; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 4005 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr2:-:18035569..18038064 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 36501.90 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 8.72 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.23 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 331 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MPVISKASST TTNSSIPSCS RIGGQLCVWP GLRQLCLRKS LLYGVMWLLS MPLKTLRGAR KTLKITHFCS ISNMPSSLKI ELVPCSKDNY AYLLHDEDTG 101: TVGVVDPSEA APVIEALSRK NWNLTYILNT HHHDDHIGGN AELKERYGAK VIGSAVDKDR IPGIDILLKD SDKWMFAGHE VRILDTPGHT QGHISFYFPG 201: SATIFTGDLI YSLSCGTLSE GTPEQMLSSL QKIVSLPDDT NIYCGRENTA GNLKFALSVE PKNETLQSYA TRVAHLRSQG LPSIPTTVKV EKACNPFLRI 301: SSKDIRKSLS IPDSATEAEA LRRIQRARDR F |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)