AT2G31350.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:mitochondrion 1.000 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : glyoxalase 2-5 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
Encodes a mitochondrial glyoxalase 2 that can accommodate a number of different metal centers and with the predominant metal center being Fe(III)Zn(II). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
glyoxalase 2-5 (GLX2-5); CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Beta-lactamase-like (InterPro:IPR001279), Hydroxyacylglutathione hydrolase (InterPro:IPR017782); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: glyoxalase 2-4 (TAIR:AT1G06130.1); Has 16142 Blast hits to 16141 proteins in 2537 species: Archae - 414; Bacteria - 10534; Metazoa - 488; Fungi - 336; Plants - 226; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 4144 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr2:+:13368451..13370802 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 35843.10 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 9.03 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.31 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 324 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MQTISKASSA TSFFRCSRKL SSQPCVRQLN IRKSLVCRVM KLVSSPLRTL RGAGKSIRVS KFCSVSNVSS LQIELVPCLK DNYAYILHDE DTGTVGVVDP 101: SEAEPIIDSL KRSGRNLTYI LNTHHHYDHT GGNLELKDRY GAKVIGSAMD KDRIPGIDMA LKDGDKWMFA GHEVHVMDTP GHTKGHISLY FPGSRAIFTG 201: DTMFSLSCGK LFEGTPKQML ASLQKITSLP DDTSIYCGHE YTLSNSKFAL SLEPNNEVLQ SYAAHVAELR SKKLPTIPTT VKMEKACNPF LRSSNTDIRR 301: ALRIPEAADE AEALGIIRKA KDDF |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)