AT3G01520.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:cytosol 0.500 plasma membrane 0.500 ASURE: cytosol,plasma membrane What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : Adenine nucleotide alpha hydrolases-like superfamily protein | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
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| Computational Description (TAIR10) |
Adenine nucleotide alpha hydrolases-like superfamily protein; FUNCTIONS IN: molecular_function unknown; INVOLVED IN: N-terminal protein myristoylation, response to stress; LOCATED IN: plasma membrane; EXPRESSED IN: 24 plant structures; EXPRESSED DURING: 15 growth stages; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: UspA (InterPro:IPR006016), Rossmann-like alpha/beta/alpha sandwich fold (InterPro:IPR014729), Universal stress protein A (InterPro:IPR006015); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: Adenine nucleotide alpha hydrolases-like superfamily protein (TAIR:AT5G14680.1); Has 2506 Blast hits to 2501 proteins in 678 species: Archae - 111; Bacteria - 1598; Metazoa - 89; Fungi - 33; Plants - 646; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 29 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr3:+:208506..209921 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 19569.40 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 5.69 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.27 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 175 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MGSEPTKVMV AVNASTIKDY PNPSISCKRA FEWTLEKIVR SNTSDFKILL LHVQVVDEDG FDDVDSIYAS PEDFRDMRQS NKAKGLHLLE FFVNKCHEIG 101: VGCEAWIKTG DPKDVICQEV KRVRPDFLVV GSRGLGRFQK VFVGTVSAFC VKHAECPVMT IKRNADETPS DPADD |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)