AT2G36900.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:golgi 1.000 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : membrin 11 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
member of Membrin Gene Family | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
membrin 11 (MEMB11); FUNCTIONS IN: SNAP receptor activity; INVOLVED IN: vesicle-mediated transport, cellular membrane fusion; LOCATED IN: endoplasmic reticulum membrane, Golgi membrane; EXPRESSED IN: 25 plant structures; EXPRESSED DURING: 15 growth stages; BEST Arabidopsis thaliana protein match is: membrin 12 (TAIR:AT5G50440.1); Has 489 Blast hits to 489 proteins in 170 species: Archae - 0; Bacteria - 0; Metazoa - 200; Fungi - 100; Plants - 135; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 54 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr2:-:15491615..15492587 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 25629.80 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 10.05 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.44 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 225 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MASGIVEGGG SLSDVYSSAK RILLKARDGI ERLERFESSS MDSPDLASSV KRDITEVRSL CSNMDTLWRS IPVKSQRDLW RRKTEQVGEE AEYLNLSLEK 101: YMSRNQRKML EAKERADLLG RASGEGAHIL QIFDEEAQAM SSVKNSKRML EESFSSGVAI LSKYAEQRDR LKSAQRKALD VLNTVGLSNS VLRLIERRNR 201: VDTWIKYAGM IATLVILYLF IRWTR |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)