AT2G33980.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:plastid 1.000 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : nudix hydrolase homolog 22 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
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| Computational Description (TAIR10) |
nudix hydrolase homolog 22 (NUDT22); FUNCTIONS IN: hydrolase activity; INVOLVED IN: biological_process unknown; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: NUDIX hydrolase domain-like (InterPro:IPR015797), NUDIX hydrolase domain (InterPro:IPR000086), NUDIX hydrolase, AtNUDT22 (InterPro:IPR017397); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: nudix hydrolase homolog 15 (TAIR:AT1G28960.5); Has 3646 Blast hits to 3645 proteins in 1317 species: Archae - 63; Bacteria - 2297; Metazoa - 168; Fungi - 177; Plants - 105; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 836 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr2:-:14356786..14359840 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 33915.60 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 6.96 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.29 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 302 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MKSGASAASP TAKSFNFGSS RLLALAQQLR VYKPPLSSSF DEREELLAYK ESTRKSITHV GFQESMAPVR FRPKKAAVLI CLFEGDDGDL RVILTKRSST 101: LSTHSGEVSL PGGKAEEHDK DDGITATREA EEEIGLDPSL VDVVAFLEPF LSQHLLRVIP VVGILWDRKA FNPTPNPAEV EAVLDAPFEM FLKDENRRSE 201: EFDWMGEKHL VHFFDYKTGD SDYVIWGLTA RILIRAATVV YQRPPAFIEQ KPNLKYSKMN QATRLYGWLK PLANLHESCE NGRLLGHVPA YCLRYLVGIS 301: SR |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)