AT2G28210.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:cytosol 0.626 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : alpha carbonic anhydrase 2 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
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| Computational Description (TAIR10) |
alpha carbonic anhydrase 2 (ACA2); FUNCTIONS IN: carbonate dehydratase activity, zinc ion binding; INVOLVED IN: response to carbon dioxide, one-carbon metabolic process; LOCATED IN: cellular_component unknown; EXPRESSED IN: stem, root; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Carbonic anhydrase, alpha-class, catalytic domain (InterPro:IPR001148), Carbonic anhydrase, alpha-class, conserved site (InterPro:IPR018338), Carbonic anhydrase, CAH1-like (InterPro:IPR018340); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: alpha carbonic anhydrase 7 (TAIR:AT1G08080.1); Has 3295 Blast hits to 3278 proteins in 530 species: Archae - 0; Bacteria - 691; Metazoa - 2036; Fungi - 83; Plants - 323; Viruses - 2; Other Eukaryotes - 160 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr2:+:12029997..12032338 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 25288.50 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 9.02 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.58 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 217 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MDEYVEDEHE FSYEWNQENG PAKWGKLRPE WKMCGKGEMQ SPIDLMNKRV RLVTHLKKLT RHYKPCNATL KNRGHDMMLK FGEEGSGSIT VNGTEYKLLQ 101: LHWHSPSEHT MNGRRFALEL HMVHENINGS LAVVTVLYKI GRPDSFLGLL ENKLSAITDQ NEAEKYVDVI DPRDIKIGSR KFYRYIGSLT TPPCTQNVIW 201: TVVKKVNTHR YFLLFFT |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)