AT2G18730.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:plasma membrane 1.000 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : diacylglycerol kinase 3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
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| Computational Description (TAIR10) |
diacylglycerol kinase 3 (DGK3); FUNCTIONS IN: diacylglycerol kinase activity; INVOLVED IN: activation of protein kinase C activity by G-protein coupled receptor protein signaling pathway; LOCATED IN: plasma membrane, membrane; EXPRESSED IN: 24 plant structures; EXPRESSED DURING: 15 growth stages; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Diacylglycerol kinase, catalytic domain (InterPro:IPR001206), Diacylglycerol kinase, accessory domain (InterPro:IPR000756), Diacylglycerol kinase, plant (InterPro:IPR016961); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: diacylglycerol kinase 7 (TAIR:AT4G30340.1); Has 1626 Blast hits to 1441 proteins in 243 species: Archae - 0; Bacteria - 214; Metazoa - 985; Fungi - 0; Plants - 266; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 161 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr2:+:8118976..8121689 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 53883.90 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 7.72 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.25 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 488 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MDSPVSKTDA SKEKFVASRP STADSKTMRG CGLANLAWVG VDKVELRQRL MMPEYLRLAM RDCIKRKDSS AIPDHLLLPG GAVADMAPHA PMVVFINPNS 101: GGRHGPVLKE RLQQLMSEEQ VFDLTEVKPH EFVRYGLGCL EKVAAEGDEC AKECRARLRI MVAGGDGTVG WVLGCLGELN KDGKSQIPPV GVIPLGTGND 201: LSRSFGWGGS FPFAWRSAVK RTLHRASMGP VARLDSWKIL VSMPSGEVVD PPYSLKPAEE NELDQGLDAG IDAPPLAKAY EGVFYNYLSI GMDAQVAYGF 301: HHLRNTKPYL AQGPISNKII YSSFGCSQGW FCTPCVNDPG LRGLRNIMKI HIKKVNCSQW EEIAVPKNVR SIVALNLHSY GSGSHPWGNL KPDYLEKRGF 401: VEAHCDDGLI EIFGFKQGWH ASFVMAELIS AKHIAQAAAV RFELRGGDWR DAFLQMDGEP WKQPMSTEYS TFVEIKKVPY QSLMINNE |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)