AT2G17620.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:nucleus 1.000 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : Cyclin B2;1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
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| Computational Description (TAIR10) |
Cyclin B2;1 (CYCB2;1); FUNCTIONS IN: cyclin-dependent protein kinase regulator activity; INVOLVED IN: regulation of cell cycle; LOCATED IN: nucleus; EXPRESSED IN: 12 plant structures; EXPRESSED DURING: 6 growth stages; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Cyclin, C-terminal (InterPro:IPR004367), Cyclin-like (InterPro:IPR011028), Cyclin, N-terminal (InterPro:IPR006671), Cyclin, A/B/D/E (InterPro:IPR014400), Cyclin (InterPro:IPR006670); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: Cyclin B2;2 (TAIR:AT4G35620.1); Has 4386 Blast hits to 4385 proteins in 373 species: Archae - 0; Bacteria - 0; Metazoa - 1994; Fungi - 552; Plants - 1134; Viruses - 37; Other Eukaryotes - 669 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr2:+:7664164..7666261 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 49245.40 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 5.18 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.26 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 429 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MVNSCENKIF VKPTSTTILQ DETRSRKFGQ EMKREKRRVL RVINQNLAGA RVYPCVVNKR GSLLSNKQEE EEGCQKKKFD SLRPSVTRSG VEEETNKKLK 101: PSVPSANDFG DCIFIDEEEA TLDLPMPMSL EKPYIEADPM EEVEMEDVTV EEPIVDIDVL DSKNSLAAVE YVQDLYAFYR TMERFSCVPV DYMMQQIDLN 201: EKMRAILIDW LIEVHDKFDL INETLFLTVN LIDRFLSKQN VMRKKLQLVG LVALLLACKY EEVSVPVVED LVLISDKAYT RNDVLEMEKT MLSTLQFNIS 301: LPTQYPFLKR FLKAAQADKK CEVLASFLIE LALVEYEMLR FPPSLLAATS VYTAQCTLDG SRKWNSTCEF HCHYSEDQLM ECSRKLVSLH QRAATGNLTG 401: VYRKYSTSKF GYIAKCEAAH FLVSESHHS |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)