AT1G18370.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:nucleus 1.000 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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| FP Images |
Arabidopsis cell culture (plastidal marker)
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : ATP binding microtubule motor family protein | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
Encodes a kinesin HINKEL. Required for cytokinesis in pollen. Mutant has cytokinesis defects; seedling lethal. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
HINKEL (HIK); FUNCTIONS IN: microtubule motor activity, ATP binding; INVOLVED IN: response to cyclopentenone, cellularization of the embryo sac, gametophyte development, pollen development, cytokinesis; LOCATED IN: chloroplast; EXPRESSED IN: 22 plant structures; EXPRESSED DURING: 13 growth stages; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Protein of unknown function DUF3490 (InterPro:IPR021881), Kinesin, motor region, conserved site (InterPro:IPR019821), Kinesin, motor domain (InterPro:IPR001752); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: ATP binding microtubule motor family protein (TAIR:AT3G43210.1); Has 14045 Blast hits to 12964 proteins in 525 species: Archae - 35; Bacteria - 375; Metazoa - 6535; Fungi - 1633; Plants - 1984; Viruses - 5; Other Eukaryotes - 3478 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr1:-:6319732..6323820 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 110181.00 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 7.92 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.67 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 974 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MTIKTPGTPV SKMDRTPAVT PGGSSRSREE KIVVTVRLRP MNKRELLAKD QVAWECVNDH TIVSKPQVQE RLHHQSSFTF DKVFGPESLT ENVYEDGVKN 101: VALSALMGIN ATIFAYGQTS SGKTYTMRGV TEKAVNDIYN HIIKTPERDF TIKISGLEIY NENVRDLLNS DSGRALKLLD DPEKGTVVEK LVEETANNDN 201: HLRHLISICE AQRQVGETAL NDTSSRSHQI IRLTIQSTHR ENSDCVRSYM ASLNFVDLAG SERASQSQAD GTRLREGCHI NLSLMTLTTV IRKLSVGKRS 301: GHIPYRDSKL TRILQHSLGG NARTAIICTL SPALAHVEQS RNTLYFANRA KEVTNNAHVN MVVSDKQLVK HLQKEVARLE AERRTPGPST EKDFKIQQME 401: MEIGELRRQR DDAQIQLEEL RQKLQGDQQQ NKGLNPFESP DPPVRKCLSY SVAVTPSSEN KTLNRNERAR KTTMRQSMIR QSSTAPFTLM HEIRKLEHLQ 501: EQLGEEATKA LEVLQKEVAC HRLGNQDAAQ TIAKLQAEIR EMRTVKPSAM LKEVGDVIAP NKSVSANLKE EITRLHSQGS TIANLEEQLE SVQKSIDKLV 601: MSLPSNISAG DETPKTKNHH HQSKKKKLLP LTPSSASNRQ NFLKSPCSPL SASRQVLDCD AENKAPQENN SSAARGATTP QGSEKETPQK GEESGDVSSR 701: EGTPGYRRSS SVNMKKMQQM FQNAAEENVR SIRAYVTELK ERVAKLQYQK QLLVCQVLEL EANDGAGYSV ENEENTIMED EEQNQVAWHI TFIEERQQII 801: ELWHVCHVSI IHRTQFYLLF KGDQADQIYM EVELRRLTWL EQHLAEVGNA TPARNCDESV VSLSSSIKAL RREREFLAKR VNSRLTPEER EELYMKWDVP 901: LEGKQRKLQF VNKLWTDPYD SRHVQESAEI VAKLVGFCES GNISKEMFEL NFAVPSDKRQ WNIGWDNISN LLHL |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)