AT2G06050.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:peroxisome 1.000 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : oxophytodienoate-reductase 3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
Encodes a 12-oxophytodienoate reductase that is required for jasmonate biosynthesis. Mutants are male sterile and defective in pollen dehiscence. Shows activity towards 2,4,6-trinitrotoluene. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
oxophytodienoate-reductase 3 (OPR3); FUNCTIONS IN: 12-oxophytodienoate reductase activity; INVOLVED IN: response to jasmonic acid stimulus, response to fungus, jasmonic acid biosynthetic process, response to wounding, response to ozone; LOCATED IN: peroxisome; EXPRESSED IN: 25 plant structures; EXPRESSED DURING: 14 growth stages; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Aldolase-type TIM barrel (InterPro:IPR013785), NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase, N-terminal (InterPro:IPR001155); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: 12-oxophytodienoate reductase 2 (TAIR:AT1G76690.1); Has 13056 Blast hits to 13024 proteins in 2039 species: Archae - 127; Bacteria - 9671; Metazoa - 31; Fungi - 870; Plants - 454; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 1903 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr2:-:2359240..2361971 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 42693.70 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 8.00 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.27 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 391 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MTAAQGNSNE TLFSSYKMGR FDLSHRVVLA PMTRCRALNG VPNAALAEYY AQRTTPGGFL ISEGTMVSPG SAGFPHVPGI YSDEQVEAWK QVVEAVHAKG 101: GFIFCQLWHV GRASHAVYQP NGGSPISSTN KPISENRWRV LLPDGSHVKY PKPRALEASE IPRVVEDYCL SALNAIRAGF DGIEIHGAHG YLIDQFLKDG 201: INDRTDQYGG SIANRCRFLK QVVEGVVSAI GASKVGVRVS PAIDHLDATD SDPLSLGLAV VGMLNKLQGV NGSKLAYLHV TQPRYHAYGQ TESGRQGSDE 301: EEAKLMKSLR MAYNGTFMSS GGFNKELGMQ AVQQGDADLV SYGRLFIANP DLVSRFKIDG ELNKYNRKTF YTQDPVVGYT DYPFLAPFSR L |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)