AT2G01670.1
Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min: :max .
SUBAcon:mitochondrion 0.926 What is SUBAcon? |
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Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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Description (TAIR10) | protein_coding : nudix hydrolase homolog 17 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Curator Summary (TAIR10) |
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Computational Description (TAIR10) |
nudix hydrolase homolog 17 (NUDT17); FUNCTIONS IN: hydrolase activity; INVOLVED IN: biological_process unknown; EXPRESSED IN: 23 plant structures; EXPRESSED DURING: 15 growth stages; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: NUDIX hydrolase domain-like (InterPro:IPR015797), NUDIX hydrolase domain (InterPro:IPR000086); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: nudix hydrolase homolog 18 (TAIR:AT1G14860.1); Has 1036 Blast hits to 1035 proteins in 308 species: Archae - 0; Bacteria - 361; Metazoa - 217; Fungi - 119; Plants - 237; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 102 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Protein Annotations |
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Coordinates (TAIR10) | chr2:-:296889..297818 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecular Weight (calculated) | 21053.40 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
IEP (calculated) | 5.41 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
GRAVY (calculated) | -0.48 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Length | 182 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MGVEKMVCLA SRTGRQFQRY NKGRRQVVGC VPYRFKLSND GKISDEVEVL VISSQKGHAL MFPKGGWELD ESVEEAASRE CLEEAGVLGN VEHQLGKWDF 101: LSKSRGTYYE GLMFPMLVTE QLELWPEQHV RQRIWMNVTE AREACRDWWM KEALDVLVER LSSPMNQPKE EKTMSISIET MC |
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See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)