AT1G01550.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:plasma membrane 0.990 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : Protein of unknown function (DUF793) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
BYPASS1, required to prevent constitutive production of a root-derived graft-transmissible signal | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
BYPASS 1 (BPS1); FUNCTIONS IN: molecular_function unknown; LOCATED IN: plasma membrane; EXPRESSED IN: 24 plant structures; EXPRESSED DURING: 13 growth stages; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Protein BYPASS related (InterPro:IPR008511); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: unknown protein (TAIR:AT2G46080.1); Has 170 Blast hits to 170 proteins in 24 species: Archae - 0; Bacteria - 0; Metazoa - 7; Fungi - 0; Plants - 160; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 3 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr1:+:200526..201575 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 38585.70 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 9.30 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.12 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 349 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MARPQDPPRG FFPFGNPFKN LSSKNSVLSS KLLPLLNNFE TNLASSISKL VPKEKSDILT VSWMKQAMES LCETHNGIKT LITDLELPVS DWEDKWVDVY 101: LDISVKLLDL CNAFSSELTR LNQGHLLLQF ALHNLEANSP QNLSKAQSSL DSWKQHIVSK NPRIENCRAI LSSLVQTLNL PKVKNSAKGK VLMRALYGVK 201: VKTLYISGVF AAAFSGSSQN LMYLTVSNEL PWAQSFMEVQ NTMNAEIKNI FLSDGLTVLK ELEAVASGVK KLYPAIQQGS IDPISLQPLK DSVTELSNGI 301: DLVSKEVDCF FKILLSGRDT LLENLRSMGA STLQATSPKK AAGKNYRGF |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)