AT1G74470.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:plastid 1.000 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : Pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase family protein | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
Encodes for a multifunctional protein with geranylgeranyl reductase activity shown to catalyze the reduction of prenylated geranylgeranyl-chlorophyll a to phytyl-chlorophyll a (chlorophyll a) and free geranylgeranyl pyrophosphate to phytyl pyrophosphate. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
Pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase family protein; FUNCTIONS IN: geranylgeranyl reductase activity; INVOLVED IN: chlorophyll biosynthetic process; LOCATED IN: chloroplast thylakoid membrane, chloroplast, membrane, chloroplast envelope; EXPRESSED IN: 24 plant structures; EXPRESSED DURING: 14 growth stages; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase (InterPro:IPR013027), Geranylgeranyl reductase (InterPro:IPR010253), Geranylgeranyl reductase, plant/cyanobacteria (InterPro:IPR011774), Geranylgeranyl reductase, plant/prokaryotic (InterPro:IPR011777); Has 4540 Blast hits to 4539 proteins in 1185 species: Archae - 562; Bacteria - 2644; Metazoa - 5; Fungi - 25; Plants - 302; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 1002 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr1:+:27991248..27992845 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 51840.50 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 9.23 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.36 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 467 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MATTVTLKSF TGLRQSSTEQ TNFVSHVPSS LSLPQRRTSL RVTAARATPK LSNRKLRVAV IGGGPAGGAA AETLAQGGIE TILIERKMDN CKPCGGAIPL 101: CMVGEFNLPL DIIDRRVTKM KMISPSNIAV DIGRTLKEHE YIGMVRREVL DAYLRERAEK SGATVINGLF LKMDHPENWD SPYTLHYTEY DGKTGATGTK 201: KTMEVDAVIG ADGANSRVAK SIDAGDYDYA IAFQERIRIP DEKMTYYEDL AEMYVGDDVS PDFYGWVFPK CDHVAVGTGT VTHKGDIKKF QLATRNRAKD 301: KILGGKIIRV EAHPIPEHPR PRRLSKRVAL VGDAAGYVTK CSGEGIYFAA KSGRMCAEAI VEGSQNGKKM IDEGDLRKYL EKWDKTYLPT YRVLDVLQKV 401: FYRSNPAREA FVEMCNDEYV QKMTFDSYLY KRVAPGSPLE DIKLAVNTIG SLVRANALRR EIEKLSV |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)