AT1G73690.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:nucleus 1.000 ASURE: nucleus What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : cyclin-dependent kinase D1;1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
cyclin dependent kinase activator CDKD;1. Nuclear localization. Involved in cell cycle regulation and cell differentiation. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
cyclin-dependent kinase D1;1 (CDKD1;1); FUNCTIONS IN: protein serine/threonine kinase activity, protein kinase activity, kinase activity, ATP binding; INVOLVED IN: cell differentiation, regulation of cell cycle; LOCATED IN: nucleus; EXPRESSED IN: shoot apex, embryo, root, flower, seed; EXPRESSED DURING: F mature embryo stage, petal differentiation and expansion stage, E expanded cotyledon stage, D bilateral stage; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Protein kinase, ATP binding site (InterPro:IPR017441), Protein kinase, catalytic domain (InterPro:IPR000719), Serine/threonine-protein kinase domain (InterPro:IPR002290), Serine/threonine-protein kinase-like domain (InterPro:IPR017442), Protein kinase-like domain (InterPro:IPR011009), Serine/threonine-protein kinase, active site (InterPro:IPR008271); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: cyclin-dependent kinase D1;3 (TAIR:AT1G18040.1); Has 124523 Blast hits to 123026 proteins in 4314 species: Archae - 100; Bacteria - 13897; Metazoa - 46445; Fungi - 12747; Plants - 30524; Viruses - 425; Other Eukaryotes - 20385 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr1:+:27715113..27717018 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 45140.80 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 9.90 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.38 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 398 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MEQPKKVADR YLKREVLGQG TYGVVFKATD TKNGETVAIK KIRLGKEKEG VNVTALREIK LLKELKHPHI IELIDAFPHK ENLHIVFEFM ETDLEAVIRD 101: RNLYLSPGDV KSYLQMILKG LEYCHGKWVL HRDMKPNNLL IGPNGQLKLA DFGLARIFGS PGRKFTHQVF ARWYRAPELL FGAKQYDGAV DVWAAGCIFA 201: ELLLRRPFLQ GNSDIDQLSK IFAAFGTPKA DQWPDMICLP DYVEYQFVPA PSLRSLLPTV SEDALDLLSK MFTYDPKSRI SIQQALKHRY FTSAPSPTDP 301: LKLPRPVSKQ DAKSSDSKLE AIKVLSPAHK FRRVMPDRGK SGNGFKDQSV DVMRQASHDG QAPMSLDFTI LAERPPNRPT ITSADRSHLK RKLDLEFL |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)