AT1G43130.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:golgi 0.999 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : like COV 2 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
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| Computational Description (TAIR10) |
like COV 2 (LCV2); CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Protein of unknown function DUF502 (InterPro:IPR007462); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: Protein of unknown function (DUF502) (TAIR:AT2G20120.1); Has 2432 Blast hits to 2432 proteins in 576 species: Archae - 20; Bacteria - 1089; Metazoa - 1; Fungi - 0; Plants - 154; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 1168 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr1:-:16228661..16231158 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 29218.10 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 6.72 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | 0.11 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 261 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MAEGKEATTS SLSQGLTPHQ DPDDAPKSPP NSPNSSTRKA CYGVLQSWVS KKFMTGFVVL FPVAVTFLIT WWFIQFVDGF FSPIYENLGV DIFGLGFITS 101: VLFTFFVGIF ASSWLGSTVF WLGEQFIRRM PFVKHIYSAS KQISTAISPD QNTTAFKEVA IIRHPRIGEY AFGFITSSVT LQTDHGEEEL CSVYVPTNHL 201: YIGDVFLVSS EEIIRPNLSI REGIEIIVSV GMTMPQVISH VDRTTNRTPH QHSLRVPLNR L |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)