AT5G51510.1
|
Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:endoplasmic reticulum 0.877 What is SUBAcon? |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||
| Experimental Localisations and PPI |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||
|
SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||
| Description (TAIR10) | protein_coding : | ||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
unknown protein; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Protein of unknown function DUF1352 (InterPro:IPR009787); Has 30201 Blast hits to 17322 proteins in 780 species: Archae - 12; Bacteria - 1396; Metazoa - 17338; Fungi - 3422; Plants - 5037; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 2996 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||
| Coordinates (TAIR10) | chr5:+:20921512..20922818 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 18234.60 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 10.51 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | 0.29 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 170 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MQQRKPTAGR PSGTDGSDFS YRMVVDSRYT KVTKEKARLR PLIFVQAAIY VIGLSCAFLT TTKKDEKNTL AIAAAVAGLV CSLIGELGCR RSRVNLLRLY 101: TAASTIVMVL SVFCAVRSRL TMEERNSSGT TAKLELAGFI CAQLGAVVQI LAIIVTGSLV NNMSPPTKAA |
||||||||||||||||||||||||||||||||
| See Also |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||
Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)