AT5G05987.1
|
Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:plasma membrane 1.000 ASURE: plasma membrane What is SUBAcon? |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Experimental Localisations and PPI |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|
SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Description (TAIR10) | protein_coding : prenylated RAB acceptor 1.A2 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
prenylated RAB acceptor 1.A2 (PRA1.A2); CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Prenylated rab acceptor PRA1 (InterPro:IPR004895); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: Cysteine/Histidine-rich C1 domain family protein (TAIR:AT3G11402.2); Has 291 Blast hits to 291 proteins in 80 species: Archae - 0; Bacteria - 0; Metazoa - 162; Fungi - 6; Plants - 119; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 4 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Coordinates (TAIR10) | chr5:+:1804881..1806559 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 24188.70 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 10.78 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | 0.26 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 209 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MDWDNVAAED VIEALREVEW STPPRSFGEF FSRFAFPRSF SKWKSRLKCN LYYYRTNYFI LVIFVLGLAL VTRPLALVGA ALTALSIAFL NDSFAASFNE 101: KFIRTIRHFS PHMAAKMRPP HMPVIRGRST ARKTVYVCGK PRWVFVITFL TASLVMWFSS CGLLWVLYAL LTSLAVIIVH ASIRTPNLKA RLNTFREEFR 201: AVWRNYSEL |
||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| See Also |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)