AT1G36160.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:cytosol 0.876 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : acetyl-CoA carboxylase 1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
Encodes acetyl-CoA carboxylase. Mutant displays uncoordinated cell divisions which are enhanced by cytokinins. Mutant also has aberrant organization of the apical region in the embryo and abnormal root and shoot development. Essential for very long chain fatty acid elongation. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
acetyl-CoA carboxylase 1 (ACC1); FUNCTIONS IN: acetyl-CoA carboxylase activity; INVOLVED IN: in 7 processes; LOCATED IN: plasma membrane; EXPRESSED IN: 26 plant structures; EXPRESSED DURING: 13 growth stages; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Acetyl-coenzyme A carboxyltransferase, N-terminal (InterPro:IPR011762), Carboxyl transferase (InterPro:IPR000022), Biotin/lipoyl attachment (InterPro:IPR000089), Carbamoyl phosphate synthase, large subunit, N-terminal (InterPro:IPR005481), PreATP-grasp-like fold (InterPro:IPR016185), ATP-grasp fold (InterPro:IPR011761), Biotin carboxylase, C-terminal (InterPro:IPR005482), Single hybrid motif (InterPro:IPR011053), Carbamoyl phosphate synthetase, large subunit, ATP-binding (InterPro:IPR005479), Acetyl-CoA carboxylase, central region (InterPro:IPR013537), Biotin carboxylation domain (InterPro:IPR011764), Biotin-binding site (InterPro:IPR001882), ATP-grasp fold, subdomain 2 (InterPro:IPR013816), Acetyl-coenzyme A carboxyltransferase, C-terminal (InterPro:IPR011763), Pre-ATP-grasp fold (InterPro:IPR013817), Rudiment single hybrid motif (InterPro:IPR011054); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: acetyl-CoA carboxylase 2 (TAIR:AT1G36180.1); Has 35904 Blast hits to 31362 proteins in 3745 species: Archae - 652; Bacteria - 22267; Metazoa - 1934; Fungi - 1046; Plants - 1042; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 8963 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr1:+:13534196..13543773 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 251396.00 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 6.49 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.22 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 2254 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
0001: MAGSVNGNHS AVGPGINYET VSQVDEFCKA LRGKRPIHSI LIANNGMAAV KFIRSVRTWA YETFGTEKAI LLVGMATPED MRINAEHIRI ADQFVEVPGG 0101: TNNNNYANVQ LIVEMAEVTR VDAVWPGWGH ASENPELPDA LDAKGIIFLG PPASSMAALG DKIGSSLIAQ AADVPTLPWS GSHVKIPPNS NLVTIPEEIY 0201: RQACVYTTEE AIASCQVVGY PAMIKASWGG GGKGIRKVHN DDEVRALFKQ VQGEVPGSPI FIMKVASQSR HLEVQLLCDK HGNVSALHSR DCSVQRRHQK 0301: IIEEGPITVA PPETVKKLEQ AARRLAKSVN YVGAATVEYL YSMDTGEYYF LELNPRLQVE HPVTEWIAEI NLPAAQVAVG MGIPLWQIPE IRRFYGIEHG 0401: GGYDSWRKTS VVAFPFDFDK AQSIRPKGHC VAVRVTSEDP DDGFKPTSGR VQELSFKSKP NVWAYFSVKS GGGIHEFSDS QFGHVFAFGE SRALAIANMV 0501: LGLKEIQIRG EIRTNVDYTI DLLHASDYRD NKIHTGWLDS RIAMRVRAER PPWYLSVVGG ALYKASATSA AVVSDYVGYL EKGQIPPKHI SLVHSQVSLN 0601: IEGSKYTIDV VRGGSGTYRL RMNKSEVVAE IHTLRDGGLL MQLDGKSHVI YAEEEAAGTR LLIDGRTCLL QNDHDPSKLM AETPCKLMRY LISDNSNIDA 0701: DTPYAEVEVM KMCMPLLSPA SGVIHFKMSE GQAMQAGELI ANLDLDDPSA VRKAEPFHGS FPRLGLPTAI SGRVHQRCAA TLNAARMILA GYEHKVDEVV 0801: QDLLNCLDSP ELPFLQWQEC FAVLATRLPK NLRNMLESKY REFESISRNS LTTDFPAKLL KGILEAHLSS CDEKERGALE RLIEPLMSLA KSYEGGRESH 0901: ARVIVHSLFE EYLSVEELFN DNMLADVIER MRQLYKKDLL KIVDIVLSHQ GIKNKNKLVL RLMEQLVYPN PAAYRDKLIR FSTLNHTNYS ELALKASQLL 1001: EQTKLSELRS NIARSLSELE MFTEDGENMD TPKRKSAINE RIEDLVSASL AVEDALVGLF DHSDHTLQRR VVETYIRRLY QPYVVKDSVR MQWHRSGLLA 1101: SWEFLEEHME RKNIGLDDPD TSEKGLVEKR SKRKWGAMVI IKSLQFLPSI ISAALRETKH NDYETAGAPL SGNMMHIAIV GINNQMSLLQ DSGDEDQAQE 1201: RVNKLAKILK EEEVSSSLCS AGVGVISCII QRDEGRTPMR HSFHWSLEKQ YYVEEPLLRH LEPPLSIYLE LDKLKGYSNI QYTPSRDRQW HLYTVTDKPV 1301: PIKRMFLRSL VRQATMNDGF ILQQGQDKQL SQTLISMAFT SKCVLRSLMD AMEELELNAH NAAMKPDHAH MFLCILREQQ IDDLVPFPRR VEVNAEDEET 1401: TVEMILEEAA REIHRSVGVR MHRLGVCEWE VRLWLVSSGL ACGAWRVVVA NVTGRTCTVH IYREVETPGR NSLIYHSITK KGPLHETPIS DQYKPLGYLD 1501: RQRLAARRSN TTYCYDFPLA FGTALELLWA SQHPGVKKPY KDTLINVKEL VFSKPEGSSG TSLDLVERPP GLNDFGMVAW CLDMSTPEFP MGRKLLVIAN 1601: DVTFKAGSFG PREDAFFLAV TELACAKKLP LIYLAANSGA RLGVAEEVKA CFKVGWSDEI SPENGFQYIY LSPEDHERIG SSVIAHEVKL SSGETRWVID 1701: TIVGKEDGIG VENLTGSGAI AGAYSKAYNE TFTLTFVSGR TVGIGAYLAR LGMRCIQRLD QPIILTGFST LNKLLGREVY SSHMQLGGPK IMGTNGVVHL 1801: TVSDDLEGVS AILNWLSYIP AYVGGPLPVL APLDPPERIV EYVPENSCDP RAAIAGVKDN TGKWLGGIFD KNSFIETLEG WARTVVTGRA KLGGIPVGVV 1901: AVETQTVMQI IPADPGQLDS HERVVPQAGQ VWFPDSAAKT AQALMDFNRE ELPLFILANW RGFSGGQRDL FEGILQAGST IVENLRTYRQ PVFVYIPMMG 2001: ELRGGAWVVV DSQINSDYVE MYADETARGN VLEPEGTIEI KFRTKELLEC MGRLDQKLIS LKAKLQDAKQ SEAYANIELL QQQIKAREKQ LLPVYIQIAT 2101: KFAELHDTSM RMAAKGVIKS VVEWSGSRSF FYKKLNRRIA ESSLVKNVRE ASGDNLAYKS SMRLIQDWFC NSDIAKGKEE AWTDDQVFFT WKDNVSNYEL 2201: KLSELRAQKL LNQLAEIGNS SDLQALPQGL ANLLNKVEPS KREELVAAIR KVLG |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)