AT3G06650.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:cytosol 1.000 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : ATP-citrate lyase B-1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
One of the two genes encoding subunit B of the trimeric enzyme ATP Citrate lyase | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
ATP-citrate lyase B-1 (ACLB-1); FUNCTIONS IN: ATP citrate synthase activity; INVOLVED IN: acetyl-CoA biosynthetic process; LOCATED IN: citrate lyase complex, membrane; EXPRESSED IN: 23 plant structures; EXPRESSED DURING: 14 growth stages; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Succinyl-CoA synthetase, beta subunit, conserved site (InterPro:IPR017866), Citrate synthase-like, small alpha subdomain (InterPro:IPR016143), Succinyl-CoA ligase, alpha subunit (InterPro:IPR005810), ATP-citrate lyase/succinyl-CoA ligase (InterPro:IPR005811), NAD(P)-binding domain (InterPro:IPR016040), CoA-binding (InterPro:IPR003781), Citrate synthase-like, core (InterPro:IPR016141), ATP-citrate lyase/succinyl-CoA ligase, active site (InterPro:IPR017440), Citrate synthase-like (InterPro:IPR002020), Succinyl-CoA synthetase-like (InterPro:IPR016102); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: ATP citrate lyase subunit B 2 (TAIR:AT5G49460.1); Has 8069 Blast hits to 8065 proteins in 2074 species: Archae - 271; Bacteria - 4029; Metazoa - 557; Fungi - 289; Plants - 162; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 2761 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr3:-:2079247..2082633 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 65817.50 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 7.91 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.01 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 608 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MATGQLFSRN TQALFYNYKQ LPIQRMLDFD FLCGRETPSV AGIINPGSEG FQKLFFGQEE IAIPVHAAIE AACAAHPTAD VFINFASFRS AAASSMAALK 101: QPTIKVVAII AEGVPESDTK QLIAYARANN KVIIGPATVG GVQAGAFKIG DTAGTIDNII QCKLYRPGSV GFVSKSGGMS NEMYNTIARV TDGIYEGIAI 201: GGDVFPGSTL SDHILRFNNI PQIKMVVVLG ELGGRDEYSL VEAMKQGKVT KPVVAWVSGT CARLFKSEVQ FGHAGAKSGG EMESAQAKNQ ALQDAGATVP 301: TSFEALEVAI KETFDKLVEE GKVSPIKEVT PPQIPEDLSS AIKSGKVRAP THIISTISDD RGEEPCYAGV PMSSIIEQGY GVGDVISLLW FKRSLPRYCT 401: KFIEICIMLC ADHGPCVSGA HNTIVTARAG KDLVSSLVSG LLTIGPRFGG AIDDAARYFK DACDRNLTPY EFVEGMKKKG IRVPGIGHRI KSRDNRDKRV 501: ELLQKFARSN FPAVKYMEYA VQVETYTLSK ANNLVLNVDG AIGSLFLDLL AGSGMFTKQE IDEIVQIGYL NGLFVLARSI GLIGHTFDQK RLKQPLYRHP 601: WEDVLYTK |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)