AT5G49460.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:cytosol 1.000 ASURE: cytosol What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : ATP citrate lyase subunit B 2 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
One of the two genes encoding subunit B of the cytosolic enzyme ATP Citrate Lyase (ACL) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
ATP citrate lyase subunit B 2 (ACLB-2); FUNCTIONS IN: ATP citrate synthase activity; INVOLVED IN: acetyl-CoA biosynthetic process; LOCATED IN: cytosol, citrate lyase complex, plasma membrane; EXPRESSED IN: 24 plant structures; EXPRESSED DURING: 13 growth stages; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Succinyl-CoA synthetase, beta subunit, conserved site (InterPro:IPR017866), Citrate synthase-like, small alpha subdomain (InterPro:IPR016143), Succinyl-CoA ligase, alpha subunit (InterPro:IPR005810), ATP-citrate lyase/succinyl-CoA ligase (InterPro:IPR005811), NAD(P)-binding domain (InterPro:IPR016040), Citrate synthase-like, core (InterPro:IPR016141), ATP-citrate lyase/succinyl-CoA ligase, active site (InterPro:IPR017440), Citrate synthase-like (InterPro:IPR002020), Succinyl-CoA synthetase-like (InterPro:IPR016102); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: ATP-citrate lyase B-1 (TAIR:AT3G06650.1); Has 1807 Blast hits to 1807 proteins in 277 species: Archae - 0; Bacteria - 0; Metazoa - 736; Fungi - 347; Plants - 385; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 339 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr5:+:20055048..20058195 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 65831.50 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 7.71 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | 0.00 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 608 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MATGQLFSRT TQALFYNYKQ LPVQRMLDFD FLCGRETPSV AGIINPGSEG FQKLFFGQEE IAIPVHAAIE AACAAHPTAD VFINFASFRS AAASSMAALK 101: QPTIKVVAII AEGVPESDTK QLIAYARANN KVVIGPATVG GIQAGAFKIG DTAGTIDNII QCKLYRPGSV GFVSKSGGMS NEMYNTVARV TDGIYEGIAI 201: GGDVFPGSTL SDHILRFNNI PQIKMMVVLG ELGGRDEYSL VEALKEGKVN KPVVAWVSGT CARLFKSEVQ FGHAGAKSGG EMESAQAKNQ ALIDAGAIVP 301: TSFEALESAI KETFEKLVEE GKVSPIKEVI PPQIPEDLNS AIKSGKVRAP THIISTISDD RGEEPCYAGV PMSSIIEQGY GVGDVISLLW FKRSLPRYCT 401: KFIEICIMLC ADHGPCVSGA HNTIVTARAG KDLVSSLVSG LLTIGPRFGG AIDDAARYFK DACDRNLTPY EFVEGMKKKG IRVPGIGHRI KSRDNRDKRV 501: ELLQKFARSN FPSVKYMEYA VTVETYTLSK ANNLVLNVDG AIGSLFLDLL AGSGMFTKQE IDEIVQIGYL NGLFVLARSI GLIGHTFDQK RLKQPLYRHP 601: WEDVLYTK |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)