AT1G76550.1
Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min: :max .
SUBAcon:cytosol 1.000 ASURE: cytosol What is SUBAcon? |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Experimental Localisations and PPI |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Description (TAIR10) | protein_coding : Phosphofructokinase family protein | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Curator Summary (TAIR10) |
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Computational Description (TAIR10) |
Phosphofructokinase family protein; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Pyrophosphate-dependent phosphofructokinase PfpB (InterPro:IPR011183), Phosphofructokinase (InterPro:IPR000023); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: Phosphofructokinase family protein (TAIR:AT1G20950.1); Has 4956 Blast hits to 4876 proteins in 1678 species: Archae - 20; Bacteria - 3823; Metazoa - 10; Fungi - 6; Plants - 430; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 667 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Protein Annotations |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Coordinates (TAIR10) | chr1:-:28722900..28726929 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecular Weight (calculated) | 67562.30 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
IEP (calculated) | 7.24 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
GRAVY (calculated) | -0.12 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Length | 617 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MDSDFGIPRE LSPLQQLRSQ YHPELPPCLQ GTTVRVELGD GTTVAKAGDA HIIARAFPHT LGQPLAHFLR ATAKVADAQI ITEHPVKRVG IVFCGRQAPG 101: GHNVVWGLYE ALKVHNAKNT LLGFLGGSEG LFAQKTLEIT DEVLQTYKNQ GGYDMLGRTK DQIRTTEQVN AALKACTDLK LDSLVIIGGV TSNTDAAHLA 201: EFFAEAKCST KVVGVPVTIN GDLKNQFVEA NVGFDTTCKV NSQLISNICT DALSAEKYYY FVRLMGRKHS HVALECTLQS HPNMVILGEE VTASKLTIFD 301: IIKQICDAVQ ARAEQDKNHG VILIPEGLVE SIPELYALLK EIHGLLKEGV QVDNISTQLS SWSSALFEFL PPFIKKQLLL HPESDDSAQL SQIETEKLLA 401: YLVETEMNKR LKEGTYKGKK FNAICHFFGY QARGSLPSKF DCDYAYVLGH VCYHILAAGL NGYMATVTNL KSPVNKWKCG AAPISAMMTV KRWSQNSGST 501: TIGRPVIHPA SVDLKGKAYD LLRQNAQKFL MEDMYRNPGP VQYDGPGADA KAVSLCVEDQ DYMGKIKKLQ EYLDQVRTIV KPGCSQDVLK AALSVMASVT 601: DVLTTISSSS TSGQQFA |
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
See Also |
|
Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)