AT1G20950.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:cytosol 1.000 ASURE: cytosol What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : Phosphofructokinase family protein | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
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| Computational Description (TAIR10) |
Phosphofructokinase family protein; FUNCTIONS IN: diphosphate-fructose-6-phosphate 1-phosphotransferase activity; INVOLVED IN: response to fructose stimulus, response to sucrose stimulus, photosynthesis, response to glucose stimulus; LOCATED IN: pyrophosphate-dependent phosphofructokinase complex, alpha-subunit complex; EXPRESSED IN: 23 plant structures; EXPRESSED DURING: 13 growth stages; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Pyrophosphate-dependent phosphofructokinase PfpB (InterPro:IPR011183), Phosphofructokinase (InterPro:IPR000023); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: Phosphofructokinase family protein (TAIR:AT1G76550.1); Has 4397 Blast hits to 4316 proteins in 1453 species: Archae - 20; Bacteria - 3299; Metazoa - 3; Fungi - 0; Plants - 433; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 642 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr1:-:7297467..7301336 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 67123.00 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 6.99 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.08 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 614 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MDSDFGIPRE LSPLQQLRSQ YKPELPPCLQ GTTVRVELGD GTTVAEAADS HTMARAFPHT LGQPLAHFLR ETAQVPDAHI ITELPSVRVG IVFCGRQAPG 101: GHNVIWGLFE ALKVHNAKST LLGFLGGSEG LFAQKTLEIT DDILQTYKNQ GGYDLLGRTK DQIKTTEQVN AALKACTDLK LDGLVIIGGV ISNTDAAHLA 201: EFFAAAKCST KVVGVPVTTN GDLKNQFVEA NVGFDTICKV NSQLISNACT DALSAEKYYY FIRLMGRKHS HVALECTLQS HPNMVILGEE VAASKLTIFD 301: IAKQICDAVQ ARAVEDKNHG VILIPEGLIV SIPEVYALLK EIHGLLRQGV SADKISTQLS PWSSALFEFL PPFIKKQLLL HPESDDSAQL SQIETEKLLA 401: YLVETEMNKR LKEGTYKGKK FNAICHFFGY QARGSLPSKF DCDYAYVLGH ICYHILAAGL NGYMATVTNL KSPVNKWKCG ATPITAMMTV KHWSQDASYT 501: LTSIGRPAIH PAMVDLKGKA YDLLRQNAQK FLMEDLYRNP GPLQYDGPGA DAKAVSLCVE DQDYMGRIKK LQEYLDQVRT IVKPGCSQDV LKAALSVMAS 601: VTDVLTTISS NGGQ |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)