AT1G31910.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:peroxisome 0.999 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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| FP Images |
Arabidopsis cell culture (plastidal marker)
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : GHMP kinase family protein | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
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| Computational Description (TAIR10) |
GHMP kinase family protein; FUNCTIONS IN: kinase activity, ATP binding; INVOLVED IN: phosphorylation; EXPRESSED IN: 24 plant structures; EXPRESSED DURING: 15 growth stages; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Phosphomevalonate kinase, eukaryotic (InterPro:IPR005916), Phosphomevalonate kinase, ERG8 (InterPro:IPR016005), Ribosomal protein S5 domain 2-type fold (InterPro:IPR020568), GHMP kinase (InterPro:IPR006204), Ribosomal protein S5 domain 2-type fold, subgroup (InterPro:IPR014721), GHMP kinase, C-terminal (InterPro:IPR013750); Has 314 Blast hits to 303 proteins in 161 species: Archae - 24; Bacteria - 53; Metazoa - 0; Fungi - 150; Plants - 51; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 36 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr1:+:11459050..11461649 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 54412.20 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 5.62 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.02 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 505 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MAVVASAPGK VLMTGGYLVL EKPNAGLVLS TNARFYAIVK PINEEVKPES WAWKWTDVKL TSPQLSRESM YKLSLNHLTL QSVSASDSRN PFVEHAIQYA 101: IAAAHLATEK DKESLHKLLL QGLDITILGS NDFYSYRNQI ESAGLPLTPE SLGTLAPFAS ITFNAAESNG ANSKPEVAKT GLGSSAAMTT AVVAALLHYL 201: GVVDLSDPCK EGKFGCSDLD VIHMIAQTSH CLAQGKVGSG FDVSCAVYGS QRYVRFSPEV LSFAQVAVTG LPLNEVIGTI LKGKWDNKRT EFSLPPLMNL 301: FLGEPGSGGS STPSMVGAVK KWQMSDPEKA RENWQNLSDA NLELETKLND LSKLAKDHWD VYLRVIKSCS VLTSEKWVLH ATEPINEAII KELLEAREAM 401: LRIRILMRQM GEAASVPIEP ESQTQLLDST MSAEGVLLAG VPGAGGFDAI FAITLGDSGT KLTQAWSSHN VLALLVREDP HGVCLESGDP RTTCITSGVS 501: SIHLE |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)