AT1G65290.1
Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min: :max .
SUBAcon:mitochondrion 1.000 ASURE: mitochondrion What is SUBAcon? |
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Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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Description (TAIR10) | protein_coding : mitochondrial acyl carrier protein 2 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Curator Summary (TAIR10) |
Encodes a member of the mitochondrial acyl carrier protein (ACP) family. As part of the mitochondrial matrix, it is likely to be involved in fatty acid or lipoic acid biogenesis. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Computational Description (TAIR10) |
mitochondrial acyl carrier protein 2 (mtACP2); FUNCTIONS IN: acyl carrier activity, cobalt ion binding, metal ion binding; INVOLVED IN: fatty acid biosynthetic process; LOCATED IN: mitochondrion, mitochondrial matrix; EXPRESSED IN: 22 plant structures; EXPRESSED DURING: 13 growth stages; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Phosphopantetheine-binding (InterPro:IPR006163), Acyl carrier protein (ACP) (InterPro:IPR003231), Acyl carrier protein-like (InterPro:IPR009081), Phosphopantetheine attachment site (InterPro:IPR006162); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: mitochondrial acyl carrier protein 1 (TAIR:AT2G44620.1); Has 8213 Blast hits to 8212 proteins in 2586 species: Archae - 0; Bacteria - 5604; Metazoa - 204; Fungi - 144; Plants - 365; Viruses - 2; Other Eukaryotes - 1894 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Protein Annotations |
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Coordinates (TAIR10) | chr1:-:24249088..24250366 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecular Weight (calculated) | 14167.90 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
IEP (calculated) | 4.62 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
GRAVY (calculated) | -0.19 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Length | 126 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MAARGAMLRY LRVNVNPTIQ NPRECVLPFS ILLRRFSEEV RGSFLDKSEV TDRVLSVVKN FQKVDPSKVT PKANFQNDLG LDSLDSVEVV MALEEEFGFE 101: IPDNEADKIQ SIDLAVDFIA SHPQAK |
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See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)