AT1G31350.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:nucleus 1.000 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : KAR-UP F-box 1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
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| Computational Description (TAIR10) |
KAR-UP F-box 1 (KUF1); CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Galactose oxidase/kelch, beta-propeller (InterPro:IPR011043), Kelch related (InterPro:IPR013089), Kelch-type beta propeller (InterPro:IPR015915); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: Galactose oxidase/kelch repeat superfamily protein (TAIR:AT1G55270.1); Has 661 Blast hits to 661 proteins in 63 species: Archae - 0; Bacteria - 29; Metazoa - 81; Fungi - 0; Plants - 548; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 3 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr1:-:11221519..11222706 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 44150.90 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 7.75 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.30 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 395 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MEKKLKRRES MSTTAAESPP AKRRRTVTGN ENSALIEGLP DHISEICLSL VHRPSLLSAV CTRWRRLLYS PEFPSFPSLY ALFVDSTSDT GRVNPSVRFM 101: CFNPVSSKWY PLPPPPPDPP LHRILYRHPS FISFNLPIQC VSAAGKLILI AGSNQQLSPA ISHPLIFDPI SSSWSSGPRI GSPRRWCATG ACDGAIYIAS 201: GISSQFSSTV AKSVEKLDLT EQNRNNHRFN WEKLRDMRDL RFSREAIDAV GYRRKLLMVN VKGDAVKEGA IYDVVKDDWE PMPEEMLVGW RGPVAAMEEE 301: ILYSVDERRG TVRKYDDEKR EWREVVVVEG GEEMLKGATQ VTADSGKLCV VTGDGKIVVV DVAAEPAKIW NVEIPDGLEP VSVHVLPRMS QPNFC |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)