AT1G19920.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:plastid 1.000 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : Pseudouridine synthase/archaeosine transglycosylase-like family protein | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
encodes a chloroplast form of ATP sulfurylase | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
APS2; FUNCTIONS IN: sulfate adenylyltransferase (ATP) activity; INVOLVED IN: sulfate assimilation; LOCATED IN: chloroplast; EXPRESSED IN: 25 plant structures; EXPRESSED DURING: 13 growth stages; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Rossmann-like alpha/beta/alpha sandwich fold (InterPro:IPR014729), Pseudouridine synthase/archaeosine transglycosylase-like (InterPro:IPR015947), Sulphate adenylyltransferase (InterPro:IPR002650); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: ATP sulfurylase 1 (TAIR:AT3G22890.1); Has 2101 Blast hits to 2098 proteins in 651 species: Archae - 98; Bacteria - 865; Metazoa - 242; Fungi - 201; Plants - 187; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 508 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr1:-:6914835..6916657 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 53641.20 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 6.58 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.38 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 476 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MSLMIRSSYV SHITLFQPRN SKPSSFTNQI SFLSSSNNNP FLNLVYKRNL TMQSVSKMTV KSSLIDPDGG ELVELIVPET EIGVKKAESE TMPKVKLNQI 101: DLEWVHVISE GWASPLKGFM REDEYLQSLH FNSLRLKNGT FVNMSLPIVL AIDDDTKEQI GSSENVALVC PQGDIIGSLR SVEIYKHNKE ERIARTWGTT 201: SPGLPYVEEY ITPSGNWLIG GDLEVFEPIK YNDGLDHYRL SPKQLREEFD NRQADAVFAF QLRNPVHNGH ALLMNDTRKR LLEMGYKNPV LLLHPLGGFT 301: KADDVPLDVR MEQHSKVLED GVLDPKTTIV SIFPSPMHYA GPTEVQWHAK ARINAGANFY IVGRDPAGMG HPTEKRDLYD PDHGKRVLSM APGLEKLNIL 401: PFRVAAYDTI EKKMAFFDPS RAKEFLFISG TKMRTYARTG ENPPDGFMCP SGWNVLVKYY ESLQESEAKQ QAVVSA |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)