AT1G16445.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:plastid 1.000 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferases superfamily protein | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
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| Computational Description (TAIR10) |
S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferases superfamily protein; INVOLVED IN: biological_process unknown; LOCATED IN: chloroplast; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Putative rRNA methylase (InterPro:IPR010719); Has 1208 Blast hits to 1208 proteins in 621 species: Archae - 2; Bacteria - 1139; Metazoa - 0; Fungi - 0; Plants - 33; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 34 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr1:+:5617811..5619303 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 30157.00 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 8.57 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | 0.10 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 274 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MAAGFFQAEM SILSSTLARS YSLPIRKTLM TFDFRIAMQR NPCLRIRRSC VAAFSSTPSH SRNFPIRGLE DVFVGYLFGR KKATEVAHVV WEQVIQKGDT 101: VIDATCGNGN DTLAMLKMVM HDSVGCGGYV YAMDIQKDAI ESTSSLLDQA VGSKEKECVK LFNLCHSKMG EIVPENARVR MVAFNLGYLP GGNKSIITLS 201: DTTLSALKAA ERILKPGGLI SLVVYIGHPG GREELEVVEA FGSGLPVSDW ICCKFQMLNR PLAPVLVFMF KREN |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)