AT1G15710.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:plastid 1.000 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : prephenate dehydrogenase family protein | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
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| Computational Description (TAIR10) |
prephenate dehydrogenase family protein; FUNCTIONS IN: prephenate dehydrogenase (NADP+) activity; INVOLVED IN: tyrosine biosynthetic process; LOCATED IN: chloroplast; EXPRESSED IN: 24 plant structures; EXPRESSED DURING: 13 growth stages; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Prephenate dehydrogenase (InterPro:IPR003099), Arogenate/prephenate dehydrogenase (InterPro:IPR012070); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: arogenate dehydrogenase (TAIR:AT5G34930.1); Has 919 Blast hits to 907 proteins in 395 species: Archae - 81; Bacteria - 505; Metazoa - 3; Fungi - 100; Plants - 115; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 115 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr1:+:5404505..5405581 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 40635.50 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 7.89 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.35 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 358 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MLLHFSPAKP LISPPNLRRN SPTFLISPPR SLRIRAIDAA QIFDYETQLK SEYRKSSALK IAVLGFGNFG QFLSKTLIRH GHDLITHSRS DYSDAANSIG 101: ARFFDNPHDL CEQHPDVVLL CTSILSTESV LRSFPFQRLR RSTLFVDVLS VKEFPKALFI KYLPKEFDIL CTHPMFGPES GKHSWSGLPF VYDKVRIGDA 201: ASRQERCEKF LRIFENEGCK MVEMSCEKHD YYAAGSQFVT HTMGRVLEKY GVESSPINTK GYETLLDLVE NTSSDSFELF YGLFMYNPNA LEQLERLDMA 301: FESVKKELFG RLHQQYRKQM FGGEVQSPKK TEQKLLNDGG VVPMNDISSS SSSSSSSS |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)