AT1G07615.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:mitochondrion 1.000 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : GTP-binding protein Obg/CgtA | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
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| Computational Description (TAIR10) |
GTP-binding protein Obg/CgtA; FUNCTIONS IN: magnesium ion binding, GTP binding, GTPase activity; LOCATED IN: intracellular; EXPRESSED IN: 14 plant structures; EXPRESSED DURING: 6 growth stages; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: GTP1/OBG subdomain (InterPro:IPR006169), GTP1/OBG (InterPro:IPR006073), GTP-binding protein, HSR1-related (InterPro:IPR002917), GTP-binding protein Obg/CgtA (InterPro:IPR014100); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: GTP1/OBG family protein (TAIR:AT5G18570.1); Has 28571 Blast hits to 22114 proteins in 2954 species: Archae - 681; Bacteria - 18882; Metazoa - 872; Fungi - 715; Plants - 429; Viruses - 2; Other Eukaryotes - 6990 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr1:-:2342277..2344200 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 54303.20 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 5.03 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.55 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 493 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MWLIRAIVPV RYLGSYKRPQ KPPWMRNPVV FYSDFSEKKG KVAPLQETRM RDRFTLYARG GEGGSGCSSV RRSRADRYGK PDGGNGGRGG DVILECTHAV 101: WDFSGLQPHI KGGKAGHGTS KNRIGNRGED KVLLVPIGTV IHLQEGEIPS QVENESPKDL DPWDLPGSLV EDPASEENSD VHQETMSESD QDDTEQESLT 201: RQLGMPKEAD FEDDDEEIDQ IRYNVAELTQ QGQRVIIARG GEGGLGNVSA TRYVRGSKFA KSTIRQTNLR SMEDDAEEDD ERSSIKAGLL GSEAVLILEL 301: KSIADVGLVG MPNAGKSTLL GALSRAKPRV GHYAFTTLRP NLGNVNYDDF SMTVADIPGL IKGAHQNRGL GHNFLRHIER TKVLAYVVDL ASGLDGCEGL 401: TPWQQLRDLV MELEFHEEGL SDRSSLIVAN KIDEEGAEER LKELKRRVKG VKIFPVCAVL EEGVAELKDG LKMLVDGNGE PSERLKLENI CVD |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)