AT5G21105.2
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:cytosol 0.840 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : Plant L-ascorbate oxidase | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
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| Computational Description (TAIR10) |
Plant L-ascorbate oxidase; FUNCTIONS IN: oxidoreductase activity, L-ascorbate oxidase activity, copper ion binding; INVOLVED IN: oxidation reduction; EXPRESSED IN: 23 plant structures; EXPRESSED DURING: 13 growth stages; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Cupredoxin (InterPro:IPR008972), Multicopper oxidase, type 2 (InterPro:IPR011706), Multicopper oxidase, copper-binding site (InterPro:IPR002355), L-ascorbate oxidase, plants (InterPro:IPR017760), Multicopper oxidase, type 1 (InterPro:IPR001117); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: Plant L-ascorbate oxidase (TAIR:AT5G21100.1); Has 4653 Blast hits to 4513 proteins in 833 species: Archae - 6; Bacteria - 1324; Metazoa - 438; Fungi - 1506; Plants - 1255; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 124 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr5:+:7174321..7177409 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 44617.50 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 9.49 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.32 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 397 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MHHICFDEKL KSILINGRGQ FNCSLAAQFS NNTSLPMCTF KEGDQCAPQI LHVEPNKTYR IRLSSTTALA SLNLAVQGHK LVVVEADGNY ITPFTTDDID 101: IYSGESYSVL LTTDQDPSQN YYISVGVRGR KPNTTQALTI LNYVTAPASK LPSSPPPVTP RWDDFERSKN FSKKIFSAMG SPSPPKKYRK RLILLNTQNL 201: IDGYTKWAIN NVSLVTPATP YLGSVKYNLK LGFNRKSPPR SYRMDYDIMN PPPFPNTTTG NGIYVFPFNV TVDVIIQNAN VLKGIVSEIH PWHLHGHDFW 301: VLGYGDGKFK PGIDEKTYNL KNPPLRNTAI LYPYGWTAIR FVTDNPGVWF FHCHIEPHLH MGMGVVFAEG LNRIGKVPDE ALGCGLTKQF LMNRNRN |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)