AT1G01950.3
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:plastid 1.000 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : armadillo repeat kinesin 2 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
Encodes a member of the armadillo/beta-catenin repeat kinesin motor family. Mutants have twisted roots due to abnormal cell file rotation; the phenotype is dependent on microtubules. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
armadillo repeat kinesin 2 (ARK2); FUNCTIONS IN: microtubule motor activity, binding, ATP binding; INVOLVED IN: root development; LOCATED IN: chloroplast; EXPRESSED IN: 23 plant structures; EXPRESSED DURING: 13 growth stages; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Kinesin, motor region, conserved site (InterPro:IPR019821), Armadillo-like helical (InterPro:IPR011989), Armadillo (InterPro:IPR000225), Armadillo-type fold (InterPro:IPR016024), Kinesin, motor domain (InterPro:IPR001752); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: armadillo repeat kinesin 3 (TAIR:AT1G12430.1); Has 18598 Blast hits to 15978 proteins in 689 species: Archae - 52; Bacteria - 737; Metazoa - 7861; Fungi - 1903; Plants - 2828; Viruses - 15; Other Eukaryotes - 5202 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr1:+:325473..330403 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 100865.00 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 7.18 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.38 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 915 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MAMASSRNGA VRGSMRPVSG ANSSNLRSSS FKSRIPSSAP APRRSSSASI GAADNGVPGR VRVAVRLRPR NADESVADAD FADCVELQPE LKRLKLRKNN 101: WDTETYEFDE VLTEAASQKR VYEVVAKPVV ESVLEGYNGT VMAYGQTGTG KTFTLGRLGD EDTAARGIMV RSMEDIIGGT SLDTDSISVS YLQLYMETIQ 201: DLLDPTNDNI AIVEDPRTGD VSLPGATHVE IRNQQNFLEL LQLGETHRVA ANTKLNTESS RSHAILMVHV KRSVVENEFP VSNEMESSSH FVRPSKPLVR 301: RSKLVLVDLA GSERVHKSGS EGHMLEEAKS INLSLSALGK CINAIAENSP HVPLRDSKLT RLLRDSFGGT ARTSLIVTIG PSPRHRGETT STILFGQRAM 401: KVENMLKIKE EFDYKSLSKK LEVQLDKVIA ENERQLKAFD DDVERINRQA QNRISEVEKN FAEALEKEKL KCQMEYMESV KKLEEKLISN QRNHENGKRN 501: GEVNGVVTAS EFTRLKESLE NEMKLRKSAE EEVSKVKSQS TLKTRSGEGE DAGITRLQKL LEDEALQKKK LEEEVTILRS QLVQLTFEAD QISLHCMPSL 601: KILLNTHVLF FQMRRCLDRG APGNSYSGTD SLPSRHSQAR ESVNGQKAPF ATLCEQVGLQ KILQLLESDD ANIRIHAVKV VANLAAEEAN QEKIVEAGGL 701: TSLLMLLRSY EDETVRRVAA GAIANLAMNE VSQQLIVDQG GISLLSLTAA DAEDPQTLRM VAGAIANLCG NDKLQARLWS DGGIKALLGM VRCGHPDVLA 801: QVARGIANFA KCESRATTQG VKSGRSLLIE DGALPWIVQH ANDEAAPIRR HIELALCHLA QHEVNAKEMI SGGALWELVR ISKECSREDI RSLAHRTLSS 901: SPVFRSEIRR LGIQF |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)