AT5G61240.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:golgi 1.000 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : Leucine-rich repeat (LRR) family protein | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
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| Computational Description (TAIR10) |
Leucine-rich repeat (LRR) family protein; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Leucine-rich repeat-containing N-terminal domain, type 2 (InterPro:IPR013210), Leucine-rich repeat (InterPro:IPR001611); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: Leucine-rich repeat (LRR) family protein (TAIR:AT1G13910.1); Has 86410 Blast hits to 27353 proteins in 1072 species: Archae - 38; Bacteria - 5910; Metazoa - 16835; Fungi - 1088; Plants - 57420; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 5119 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr5:+:24629485..24631958 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 36797.90 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 8.55 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.00 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 326 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MASRCELLLI CVFSLLIAFA HSKTLKRDVK ALNEIKASLG WRVVYSWVGD DPCGDGDLPP WSGVTCSTQG DYRVVTELEV YAVSIVGPFP IAVTNLLDLT 101: RLDLHNNKLT GPIPPQIGRL KRLKVLNLRW NKLQDVIPPE IGELKRLTHL YLSFNSFKGE IPKELAALPE LRYLYLQENR LIGRIPAELG TLQNLRHLDV 201: GNNHLVGTIR ELIRFDGSFP ALRNLYLNNN YLSGGIPAQL SNLTNLEIVY LSYNKFIGNI PFAIAHIPKL TYLYLDHNQF TGRIPDAFYK HPFLKEMYIE 301: GNMFKSGVNP IGTHKVLEVS DADFAV |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)