AT5G40930.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:mitochondrion 1.000 ASURE: mitochondrion What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : translocase of outer membrane 20-4 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
Form of TOM20, which is a component of the TOM complex involved in transport of nuclear-encoded mitochondrial proteins | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
translocase of outer membrane 20-4 (TOM20-4); FUNCTIONS IN: P-P-bond-hydrolysis-driven protein transmembrane transporter activity; INVOLVED IN: protein targeting to mitochondrion; LOCATED IN: plasma membrane, mitochondrial outer membrane translocase complex, mitochondrial inner membrane presequence translocase complex; EXPRESSED IN: 25 plant structures; EXPRESSED DURING: 15 growth stages; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Plant specific mitochondrial import receptor subunit TOM20 (InterPro:IPR010547); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: translocase of outer membrane 20 kDa subunit 3 (TAIR:AT3G27080.1); Has 1807 Blast hits to 1807 proteins in 277 species: Archae - 0; Bacteria - 0; Metazoa - 736; Fungi - 347; Plants - 385; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 339 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr5:+:16404523..16405825 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 20973.80 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 5.32 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.35 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 187 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MDMQNENERL MVFEHARKVA EATYVKNPLD AENLTRWAGA LLELSQFQTE PKQMILEAIL KLGEALVIDP KKHDALWLIG NAHLSFGFLS SDQTEASDNF 101: EKASQFFQLA VEEQPESELY RKSLTLASKA PELHTGGTAG PSSNSAKTMK QKKTSEFKYD VFGWVILASY VVAWISFANS QTPVSRQ |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)