AT5G03140.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:extracellular 0.980 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : Concanavalin A-like lectin protein kinase family protein | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
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| Computational Description (TAIR10) |
Concanavalin A-like lectin protein kinase family protein; FUNCTIONS IN: carbohydrate binding, kinase activity; INVOLVED IN: protein amino acid phosphorylation; LOCATED IN: endomembrane system; EXPRESSED IN: 19 plant structures; EXPRESSED DURING: 13 growth stages; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Legume lectin, beta chain (InterPro:IPR001220), Protein kinase, ATP binding site (InterPro:IPR017441), Serine/threonine-protein kinase-like domain (InterPro:IPR017442), Concanavalin A-like lectin/glucanase, subgroup (InterPro:IPR013320), Protein kinase-like domain (InterPro:IPR011009), Serine/threonine-protein kinase, active site (InterPro:IPR008271), Protein kinase, catalytic domain (InterPro:IPR000719), Concanavalin A-like lectin/glucanase (InterPro:IPR008985), Legume lectin, beta chain, Mn/Ca-binding site (InterPro:IPR019825); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: Concanavalin A-like lectin protein kinase family protein (TAIR:AT3G53380.1); Has 119630 Blast hits to 118238 proteins in 4320 species: Archae - 113; Bacteria - 13850; Metazoa - 43549; Fungi - 10287; Plants - 34091; Viruses - 415; Other Eukaryotes - 17325 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr5:-:737750..739885 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 77123.90 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 6.39 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.09 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 711 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MLKLPPRFFS VYSTLIHILA SFLCSSDVRG DFPATRFDLG TLTLSSLKLL GDAHLNNGTI KLTRELSVPT STAGKALYGK PVKFRHPETK SPASFTTYFS 101: FSVTNLNPSS IGGGLAFVIS PDEDYLGSTG GFLGLTEETG SGSGFVAVEF DTLMDVQFKD VNGNHVGLDL NAVVSAAVAD LGNVDIDLKS GNAVNSWITY 201: DGSGRVLTVY VSYSNLKPKS PILSVPLDLD RYVSDSMFVG FSGSTQGSTE IHSVDWWSFS SSFEESSESP PPMPNSPPPS SPSSSITPSL STVRRKTADP 301: SSSCRNKLCK KSPAAVAGVV TAGAFFLALF AGVIIWVYSK KIKYTRKSES LASEIMKSPR EFTYKELKLA TDCFSSSRVI GNGAFGTVYK GILQDSGEII 401: AIKRCSHISQ GNTEFLSELS LIGTLRHRNL LRLQGYCREK GEILLIYDLM PNGSLDKALY ESPTTLPWPH RRKILLGVAS ALAYLHQECE NQIIHRDVKT 501: SNIMLDANFN PKLGDFGLAR QTEHDKSPDA TAAAGTMGYL APEYLLTGRA TEKTDVFSYG AVVLEVCTGR RPITRPEPEP GLRPGLRSSL VDWVWGLYRE 601: GKLLTAVDER LSEFNPEEMS RVMMVGLACS QPDPVTRPTM RSVVQILVGE ADVPEVPIAK PSSSMSFSTS ELLLTLQDSV SDCNEVLAPI STTSCSSSEH 701: DIFIVGKDRS V |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)